（生信）科研工具+经验
关注
分享
扫一扫
文章平均质量分 67
主要是科研过程中的工具、经验，以及生信一些经验操作、原理等
纪伊路上盛名在
生信研在读，聚焦表观+3D，多组学+结构，自学编程技能+深度学习新手中，交流多多！
Note：Nothing is impossible！非一日之功也，戒骄戒躁！
展开
-
uniprot系列相关数据库介绍
研究蛋白质序列、结构、家族进化关系时会用上的数据库原创 2025-02-23 18:57:20 · 1043 阅读 · 0 评论 -
LLM赋能6-web端Chatbot再更新（待续）
deepseek也可以在网页端弹窗使用原创 2025-02-15 17:13:10 · 216 阅读 · 0 评论 -
一个好用的微信聊天记录提取工具
一键保存你微信上的科研聊天记录，或者是其他聊天记录原创 2025-01-28 23:27:11 · 649 阅读 · 0 评论 -
生信软件管家——conda vs pip
使用 conda 安装包之前，需要用search命令搜索 conda 包，找到安装对应包的命令后再进行安装，如果不能在下面的链接中找到安装方法，即表明该包不能通过 conda 安装。可以看到，在创建环境时指定 python 版本，和创建完环境后安装 python 的指定版本两者导致的结果并无不同，那为什么官方推荐在创建环境时使用 python=3.9 的方式指定 python。上面几个国内镜像源没有一个是绝对稳定的，都有可能抽风，连接不上，这时可以切换为其他国内镜像源。这时可以切换为其他国内镜像源。原创 2025-01-23 21:00:25 · 1391 阅读 · 0 评论 -
LLM赋能5—语音vs文字信息量：NotebookLM
LLM多模态之语音输出原创 2025-01-22 20:45:55 · 786 阅读 · 0 评论 -
用vscode写latex-2
vscode上写latex，解决引用来源问题原创 2025-01-15 17:11:06 · 311 阅读 · 0 评论 -
在vscode中使用R-1
承接上一篇博客，如何在vscode中集成R原创 2025-01-14 17:40:21 · 1098 阅读 · 0 评论 -
系统发生分析1——经典序列分析
用于系统发生分析的序列分析工具原创 2025-01-13 18:41:59 · 612 阅读 · 0 评论 -
用vscode写latex-1
在vscode上写latex原创 2025-01-12 20:19:23 · 985 阅读 · 0 评论 -
AI代码编辑器
AI代码编辑器原创 2025-01-01 23:18:29 · 6071 阅读 · 0 评论 -
Automa-web端自动化神器
基本处理模式其实和我之前博客提到的easyspider类似，具体工具使用体验&方法另开一篇博客来讲。可视化配置+工作流+自动化执行浏览器插件。原创 2025-01-01 18:03:12 · 571 阅读 · 0 评论 -
bigwig（bw）文件转换为bed文件：
bigwig文件转换为bed文件原创 2024-12-31 23:06:22 · 733 阅读 · 0 评论 -
使用命令行将现有文件上传并提交到github存储库
所有工程项目进度上传到github中原创 2024-12-30 17:40:12 · 486 阅读 · 0 评论 -
八爪鱼&easyspider：
接续上篇自动爬虫博客原创 2024-12-29 23:58:57 · 307 阅读 · 0 评论 -
Max AI prompt2：
max ai prompt2原创 2024-12-26 09:22:31 · 458 阅读 · 0 评论 -
Max AI prompt1
web端LLM QA插件prompt原创 2024-12-24 10:28:58 · 385 阅读 · 0 评论 -
文献阅读web端插件3：
LLM翻译插件原创 2024-12-23 16:22:49 · 754 阅读 · 0 评论 -
爬虫1：uniprot蛋白质序列数据+canvas图片
爬虫1：主插件原创 2024-12-22 22:03:31 · 1349 阅读 · 0 评论 -
文献阅读web端插件2：
文献阅读LLM插件2原创 2024-12-08 17:31:42 · 782 阅读 · 0 评论 -
pubmed关键词搜索技能1：待更新
pubmed搜索技巧1原创 2024-12-06 21:55:28 · 374 阅读 · 0 评论 -
各种常见生信格式文件的随机抽样
生信数据下采样原创 2024-12-05 23:10:00 · 266 阅读 · 0 评论 -
文献阅读web端插件1：
网页端文献阅读插件原创 2024-12-05 18:32:11 · 750 阅读 · 0 评论 -
记Rstudio报错1
R报错1原创 2024-12-03 23:22:10 · 270 阅读 · 0 评论 -
生科院秋季学期教师一览：专业领域找专业人
生科院秋季排课原创 2024-12-02 16:19:45 · 215 阅读 · 0 评论 -
如何制作墙报（poster）：器非术
制作poster墙报原创 2024-12-01 13:21:33 · 355 阅读 · 0 评论 -
下载SRA序列数据——ascp（前期草稿，未上传待更新）
下载sra序列数据：ascp，待更新原创 2024-11-30 19:36:04 · 1131 阅读 · 0 评论 -
3SLK PDB数据格式一览（结构生物学）
PDB数据格式一览（简要）原创 2024-11-30 19:29:47 · 327 阅读 · 0 评论 -
系统生物学、生物信息学、计算生物学、生物统计学等lab&PI收集1：
做干实验，万事留一线原创 2024-11-13 19:12:40 · 268 阅读 · 1 评论 -
bio背景hub1：转录起始位点与启动子
转录前后gene结构，在生信水平上原创 2024-11-12 13:40:10 · 1266 阅读 · 0 评论 -
ML1：sklearn env
初始sklearn env原创 2024-11-08 08:08:40 · 362 阅读 · 0 评论 -
远程服务：MRD+parsec主
pad是玩具，还是用pc2pc原创 2024-11-04 16:36:53 · 1355 阅读 · 0 评论 -
科研修图Adobe全家桶access
科研修图使用adobe：PS+AI原创 2024-10-31 22:17:46 · 456 阅读 · 0 评论 -
搭配PDB使用pymol
pymol的基本操作，其余要做的就是上手分子动力学的东西原创 2024-10-29 12:12:00 · 1517 阅读 · 0 评论 -
服务器与服务器之间文件上传下载
内网穿透之后服务器之间上传下载文件原创 2024-10-29 11:58:01 · 592 阅读 · 0 评论 -
LLM再赋能1：vscode中提升效率的插件扩展——待更新
vscode插件更新原创 2024-10-28 11:32:19 · 751 阅读 · 1 评论 -
内网穿透问题
内网穿透，frp的原理需要深入理解原创 2024-10-24 13:40:25 · 960 阅读 · 0 评论 -
文献分区查询
学术期刊查询原创 2024-10-17 11:28:13 · 5293 阅读 · 0 评论 -
tmux中hic-pro执行中断，使用tmux插件自动保存session
tmux自动保存session插件原创 2024-10-15 17:38:50 · 552 阅读 · 0 评论 -
安装rstudio-server
ROOT权限安装rstudio-server原创 2024-10-12 21:48:04 · 487 阅读 · 2 评论 -
top以及htop任务监管
起因是本来数据就大，但是服务器配置比较弱，然后抛弃任务来却是cpu占用率连1%都不到，一时不知道到底是shell脚本写错了还是服务器被cpu limit了。其实可以使用conda search+install。本人用的最多的是-c，看细致的所有人跑的命令是什么。服务器只有4核心8线程。原创 2024-10-08 21:11:26 · 207 阅读 · 0 评论