1. 第一代测序(Sanger测序)
- 特点:精准抄写员
- 像一个认真抄书的人,每次只能抄写一页纸(短片段),但几乎不出错。
- 优点:准确率极高(99.99%),适合验证关键片段(比如检测某个基因的特定突变)。
- 缺点:速度慢、成本高,无法测整本书(全基因组)。
- 应用场景:新冠测序、单基因病检测(如耳聋基因验证)。
举个栗子:
你有一本《哈利波特》,但只想知道第100页的内容。Sanger测序会精准抄写这一页,但不管其他页。
2. 第二代测序(NGS,高通量测序)
- 特点:高速复印机
- 把书撕成无数碎片,同时复印所有碎片,再拼回完整书。
- 优点:速度快、成本低,能测整本书(全基因组)或重点章节(靶向基因panel)。
- 缺点:每页被撕得太碎(短读长),拼回去可能出错(比如重复序列难分辨)。
- 应用场景:癌症基因检测、无创产前筛查(NIPT)、病原微生物检测。
举个栗子:
把《哈利波特》撕成纸条,每张纸条复印100次,最后用电脑拼出完整故事。但遇到重复句子(如“伏地魔回来了”),可能拼错位置。
3. 第三代测序(单分子测序)
- 特点:高清扫描仪
- 直接扫描整本书,不撕碎、不复印,能看到长段落甚至整章内容。
- 优点:读长超长(几万到百万字母),能检测复杂结构(如染色体倒位、重复序列)。
- 缺点:偶尔扫描模糊(错误率较高,约15%),设备贵。
- 应用场景:研究基因组结构变异、古DNA测序、未知物种基因组组装。
举个栗子:
用扫描仪一页页扫《哈利波特》,直接看到完整章节,甚至发现作者用隐形墨水写的隐藏剧情(复杂结构变异)。
总结对比
一代测序 | 二代测序 | 三代测序 | |
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读长 | 短(~1000字母) | 短(50-300字母) | 超长(几万字母) |
速度 | 慢(几天) | 快(几小时到几天) | 中等(几小时到几天) |
成本 | 高(按字数收费) | 低(按整本书收费) | 极高(VIP包场扫描) |
用途 | 精准验证单点突变 | 大规模筛查多基因 | 破解基因组复杂谜题 |
一句话记住:
- 一代:精准但慢(验钞机)
- 二代:高效便宜(流水线工厂)
- 三代:看大局(天文望远镜)