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RSS订阅原创 动物线粒体基因组组装基本流程——GetOrganelle
大多数动物线粒体基因组为双链环状DNA分子（J链和N链)。非孟德尔遗传，一般为母系遗传。也有部分为父系遗传，例如哺乳动物中绵羊。动物的线粒体基因组一般15～20 kb。线粒体是古老的具有自主复制和遗传能力的细胞器。重组是线粒体基因组进化的主要方式。动物线粒体基因组结构相对保守，基因排列紧凑，这些特点都跟植物叶绿体基因组相似。
2024-07-13 17:22:36
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原创 GC-depth分析
GC depth分布图可以看出测序是否有明显的GC偏向。如果存在样品污染，通常能够从GC含量分析中呈现出来，出现独立的序列簇。异常的GCdepth可能的原因：深度一半可能与动物的性染色体和高杂合有关，其它情况多为污染，例如GC高可能是细菌污染。下图为异常情况的图：下图为正常情况图：横坐标表示GC含量，纵坐标表示测 序深度，右方是contig覆盖深度分布，上方是GC含量分布，根据其GC分布 以及覆盖深度信息绘制散点图，其中红色的部分代表该散点图中点的 密度比较大的部分，用红色表示。
2024-07-12 11:33:14
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空空如也
空空如也
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