下载ncbi的linux安装包:Index of /blast/executables/blast+/LATEST
通过filezilla将其导入linux环境。
解压及安装:Linux下BLAST的安装与使用 · 大专栏
使用:需要先建库
makeblastdb -in 基因组数据库.pep.fa -dbtype prot -parse_seqids
再进行blastp:
blastp -query 目标序列.txt -out 输出文件.pep.fa -db 数据库.pep.fa -outfmt 6 -evalue 1e-100 -num_threads 4