Vasp从零单排篇

1.Vasp是运行在linux服务器环境下的第一性原理计算软件,使用者只负责给出输入,Vasp计算出结果输出,然后再对输出结果进行处理分析,从技术上来说,第一性原理计算的工作更像运维。

 

2.由于Vasp运行在linux服务器环境,Windows用户首先需要借助XShell通过SSH远程连接到服务器,由于涉及到文件传输,借助封装有FTP协议的XFTP或WINSCP工具进行文件的上传和下载

 

3. Vasp的输入文件有四个,分别是INCAR,POSCAR,KPOINTS,POTCAR

其中INCAR是告诉Vasp需要做什么类型的计算,以及计算参数,这个文件的编写是有套路的。后面再说。

POSCAR是输入体系的坐标构型,对于简单体系,可以从计算数据库中直接拿到,这样节约时间。

KPOINTS是k点信息,对于自洽计算,使用自动的取点可以解决,麻烦的是能带计算沿着某一条线采点,可以借助Vaspkit完成。

POTCAR是Vasp官方提供,Vasp提供了每一种元素的赝势。对于化合物,需要进行赝势的拼接

cat POTCAR_Cu POTCAR_C POTCAR_H POTCAR_O > POTCAR

4. 我们关注的主要是能带计算,对于能带计算而言,主要分为以下三步进行

(1) 结构优化   

(2) 自洽计算

(3) 取沿着线的K点计算

 

三步计算中,POTCAR只需要一步制备,POSCAR也比较简单,INCAR比较难,三步的INCAR不同,但具有套路模性。

(1)(2)的KPOINTS自动生成,(3)的KPOINTS使用Vaspkit工具生成。

 

5. 如何分析计算结果?Vasp将输出文件输出到Vasprun.xml文件中, 通过使用Python中的库pymatgen解析xml文件,得到能带数据,并画图。

 

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