算法导论学习笔记(9)——动态规划之最长公共子序列

【问题】 求两字符序列的最长公共字符子序列

问题描述:字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地(不一定连续)去掉若干个字符(可能一个也不去掉)后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0,x1,…,xm-1,序列Y=“y0,y1,…,yk-1X的子序列,存在X的一个严格递增下标序列<i0,i1,…,ik-1>,使得对所有的j=0,1,…,k-1,有xij=yj。例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一个子序列。

考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题,设A=“a0,a1,…,am-1B=“b0,b1,…,bm-1,并Z=“z0,z1,…,zk-1为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质:

(1如果am-1=bn-1,则zk-1=am-1=bn-1,且“z0,z1,…,zk-2是“a0,a1,…,am-2和“b0,b1,…,bn-2的一个最长公共子序列;

(2如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=am-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1是“a0,a1,…,am-2和“b0,b1,…,bn-1的一个最长公共子序列;

(3如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=bn-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1是“a0,a1,…,am-1和“b0,b1,…,bn-2的一个最长公共子序列。

这样,在找A和B的公共子序列时,如有am-1=bn-1,则进一步解决一个子问题,找“a0,a1,…,am-2和“b0,b1,…,bm-2的一个最长公共子序列;如果am-1!=bn-1,则要解决两个子问题,找出“a0,a1,…,am-2和“b0,b1,…,bn-1的一个最长公共子序列和找出“a0,a1,…,am-1和“b0,b1,…,bn-2的一个最长公共子序列,再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。

求解:

引进一个二维数组c[][],用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度,b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的,以决定搜索的方向。
我们是自底向上进行递推计算,那么在计算c[i,j]之前,c[i-1][j-1],c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j],就可以计算出c[i][j]。

问题的递归式写成:


recursive formula

回溯输出最长公共子序列过程:

flow

算法分析:
由于每次调用至少向上或向左(或向上向左同时)移动一步,故最多调用(m + n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况,此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反,步数相同,故算法时间复杂度为Θ(m + n)。

代码:

#include<stdio.h>
#include
<string.h>
#define MAXLEN 100

void LCSLength(char*x,char*y,int m,int n,int c[][MAXLEN],int b[][MAXLEN])
{
   
int i, j;
   
   
for(i=0; i<= m; i++)
        c[i][
0]=0;
   
for(j=1; j<= n; j++)
        c[
0][j]=0;
   
for(i=1; i<= m; i++)
{
       
for(j=1; j<= n; j++)
   
{
           
if(x[i-1]== y[j-1])
         
{
                c[i][j]
= c[i-1][j-1]+1;
                b[i][j]
=0;
            }

           
elseif(c[i-1][j]>= c[i][j-1])
         
{
                c[i][j]
= c[i-1][j];
                b[i][j]
=1;
            }

           
else
         
{
                c[i][j]
= c[i][j-1];
                b[i][j]
=-1;
            }

        }

    }

}


void PrintLCS(int b[][MAXLEN],char*x,int i,int j)
{
   
if(i==0|| j==0)
       
return;
   
if(b[i][j]==0)
  
{
        PrintLCS(b, x, i
-1, j-1);
        printf(
"%c", x[i-1]);
    }

   
elseif(b[i][j]==1)
        PrintLCS(b, x, i
-1, j);
   
else
        PrintLCS(b, x, i, j
-1);
}


int main(int argc,char**argv)
{
   
char x[MAXLEN]={"ABCBDAB"};
  
char y[MAXLEN]={"BDCABA"};
   
int b[MAXLEN][MAXLEN];
   
int c[MAXLEN][MAXLEN];
   
int m, n;
   
    m
= strlen(x);
    n
= strlen(y);
   
    LCSLength(x, y, m, n, c, b);
    PrintLCS(b, x, m, n);
   
   
return0;
}

 

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