【问题】 求两字符序列的最长公共字符子序列
问题描述:字符序列的子序列是指从给定字符序列中随意地(不一定连续)去掉若干个字符(可能一个也不去掉)后所形成的字符序列。令给定的字符序列X=“x0,x1,…,xm-1”,序列Y=“y0,y1,…,yk-1”是X的子序列,存在X的一个严格递增下标序列<i0,i1,…,ik-1>,使得对所有的j=0,1,…,k-1,有xij=yj。例如,X=“ABCBDAB”,Y=“BCDB”是X的一个子序列。
考虑最长公共子序列问题如何分解成子问题,设A=“a0,a1,…,am-1”,B=“b0,b1,…,bm-1”,并Z=“z0,z1,…,zk-1”为它们的最长公共子序列。不难证明有以下性质:
(1) 如果am-1=bn-1,则zk-1=am-1=bn-1,且“z0,z1,…,zk-2”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列;
(2) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=am-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列;
(3) 如果am-1!=bn-1,则若zk-1!=bn-1,蕴涵“z0,z1,…,zk-1”是“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列。
这样,在找A和B的公共子序列时,如有am-1=bn-1,则进一步解决一个子问题,找“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bm-2”的一个最长公共子序列;如果am-1!=bn-1,则要解决两个子问题,找出“a0,a1,…,am-2”和“b0,b1,…,bn-1”的一个最长公共子序列和找出“a0,a1,…,am-1”和“b0,b1,…,bn-2”的一个最长公共子序列,再取两者中较长者作为A和B的最长公共子序列。
求解:
引进一个二维数组c[][],用c[i][j]记录X[i]与Y[j] 的LCS 的长度,b[i][j]记录c[i][j]是通过哪一个子问题的值求得的,以决定搜索的方向。
我们是自底向上进行递推计算,那么在计算c[i,j]之前,c[i-1][j-1],c[i-1][j]与c[i][j-1]均已计算出来。此时我们根据X[i] = Y[j]还是X[i] != Y[j],就可以计算出c[i][j]。
问题的递归式写成:
回溯输出最长公共子序列过程:
算法分析:
由于每次调用至少向上或向左(或向上向左同时)移动一步,故最多调用(m + n)次就会遇到i = 0或j = 0的情况,此时开始返回。返回时与递归调用时方向相反,步数相同,故算法时间复杂度为Θ(m + n)。
代码:
#include<stdio.h>
#include<string.h>
#define MAXLEN 100
void LCSLength(char*x,char*y,int m,int n,int c[][MAXLEN],int b[][MAXLEN])
{
int i, j;
for(i=0; i<= m; i++)
c[i][0]=0;
for(j=1; j<= n; j++)
c[0][j]=0;
for(i=1; i<= m; i++)
{
for(j=1; j<= n; j++)
{
if(x[i-1]== y[j-1])
{
c[i][j]= c[i-1][j-1]+1;
b[i][j]=0;
}
elseif(c[i-1][j]>= c[i][j-1])
{
c[i][j]= c[i-1][j];
b[i][j]=1;
}
else
{
c[i][j]= c[i][j-1];
b[i][j]=-1;
}
}
}
}
void PrintLCS(int b[][MAXLEN],char*x,int i,int j)
{
if(i==0|| j==0)
return;
if(b[i][j]==0)
{
PrintLCS(b, x, i-1, j-1);
printf("%c", x[i-1]);
}
elseif(b[i][j]==1)
PrintLCS(b, x, i-1, j);
else
PrintLCS(b, x, i, j-1);
}
int main(int argc,char**argv)
{
char x[MAXLEN]={"ABCBDAB"};
char y[MAXLEN]={"BDCABA"};
int b[MAXLEN][MAXLEN];
int c[MAXLEN][MAXLEN];
int m, n;
m= strlen(x);
n= strlen(y);
LCSLength(x, y, m, n, c, b);
PrintLCS(b, x, m, n);
return0;
}