Sklearn实现DBSCAN聚类

The DBSCAN 算法将簇视为被低密度区域分隔的高密度区域。由于这个相当普遍的观点, DBSCAN发现的簇可以是任何形状的,与假设簇是凸的 K-means 相反。 DBSCAN 的核心概念是 core samples, 是指位于高密度区域的样本。 因此一个簇是一组核心样本,每个核心样本彼此靠近(通过某个距离度量测量) 和一组接近核心样本的非核心样本(但本身不是核心样本)。算法中的两个参数, min_samples 和 eps,正式的定义了我们所说的 稠密(dense)。较高的 min_samples 或者较低的 eps 都表示形成簇所需的较高密度。

更正式的,我们定义核心样本是指数据集中的一个样本的 eps 距离范围内,存在 min_samples 个其他样本,这些样本被定为为核心样本的邻居( neighbors) 。这告诉我们,核心样本在向量空间的稠密区域。一个簇是一个核心样本的集合,可以通过递归来构建,选取一个核心样本,查找它所有的邻居样本中的核心样本,然后查找新获取的核心样本的邻居样本中的核心样本,递归这个过程。 簇中还具有一组非核心样本,它们是簇中核心样本的邻居的样本,但本身并不是核心样本。 显然,这些样本位于簇的边缘。

根据定义,任何核心样本都是簇的一部分,任何不是核心样本并且和任意一个核心样本距离都大于eps 的样本将被视为异常值。

当参数min_samples 主要表示算法对噪声的容忍度(当处理大型噪声数据集时, 需要考虑增加该参数的值), 针对具体地数据集和距离函数,参数eps 如何进行合适地取值是非常关键,这通常不能使用默认值。参数eps控制了点地领域范围。如果取值太小,大部分地数据并不会被聚类(被标注为 -1 代表噪声); 如果取值太大,可能会 导致 相近 的多个簇被合并成一个,甚至整个数据集都被分配到一个簇。一些启发式(heuristics)参数选择方法已经在一些文献上讨论过了,例如,在最近邻距离图种,基于Knee的参数选择方式(在下面引用的资料里已讨论过了).

在下图中,颜色表示簇成员属性,大圆圈表示算法发现的核心样本。较小的圈子表示仍然是簇的一部分的非核心样本。 此外,异常值由下面的黑点表示。

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