XIUXIU179的博客

        生物信息学中的主要对象毫无疑问就是生物序列,在本章中,我们将介绍Biopython 中的技巧来处理序列--Seq 对象。         序列从本质上将是像 AGTACACTGGT 这样的一系列字母,这看上去很自然,因为这是生物学文件格式中所看到的序列的最常见方式。         在 Seq 对象和python 序列间有两个重要的不同点。        首先, Seq 对象包含有...

1 分析或读取序列         Bio.SeqIO.parse()将序列数据读成 SeqRecord 对象。它有两个参数:第一个参数是要读取的 handle。handle 是一个要读的打开文件,但是可以从命令行输出,或者可以从网上下载。第二个参数是一个小写的序列特征格式--我们不会为你猜想文件格式。到http://biopython.org/wiki/SeqIO 查 看 支 持 的 文 件 格...