2020年03月_Drone_xjw

原创 coursera北京大学生物信息学（第五-第六周）课程笔记

如果觉得有用，谢谢点赞鼓励课程笔记如果觉得有用，谢谢点赞鼓励第一课新一代测序第一课新一代测序主要讲解了新一代测序在DNA、RNA和蛋白质方面的应用。并且测序结果包含了测序误差信息(转化为ASCII码)。／１和／２表示一条链的两头测序...

2020-03-31 13:49:14 826 2

原创 coursera北京大学生物信息学（第三-第四周课程笔记）

如果觉得有用，谢谢点赞鼓励课程笔记如果觉得有用，谢谢点赞鼓励第三周第一课第二课第三周第一课通过上周的动态规划算法引入了blast算法，这也是现在常用的序列比对算法。swiss-prot数据库的数据是经过科研人员验证过的数据，所以也更为可靠。与Needleman-Wunsch、Smith-Waterman等基于动态规划的算法不同， BLAST是一种启发式的算法，也就是说，它并不确保能...

2020-03-27 22:37:22 717 1

原创 R语言错误: `data` and `reference` should be factors with the same levels.

谢谢点击进来，如果您觉得有用，麻烦点赞鼓励一下！报错如下图：这个问题困扰了好久，看这个信息也没看到是哪里出错，然后一行一行执行。最终找到了rf.confusionMatrix <- confusionMatrix(rf.class , data.test$Class, positive = "T")这行代码是通过预测出来的结果和测试集比较，生成混淆矩阵。那么这个levels指的就...

2020-03-25 16:52:33 7940 2

原创 R语言用ROCR包出现载入程辑包：‘gplots’ The following object is masked from ‘package:stats’错误

谢谢点进来，如果你觉得有帮助，麻烦点个赞。假如在R studio运行的代码是这样的：library(ROCR)首先看到这个问题的时候，我认为是你没有安装gplots包，可以按下图所示看是否有该包，如果没有则点击install输入包名安装。奇怪的是本机有这个包，为什么还报错无法载入呢？原来是两个包中有函数重名了。这时候，我们只需要加上一句,就可以解决了，意思就是屏蔽这个警告信息 ...

2020-03-25 16:30:10 14112 2

原创 flyway出现org.flywaydb.core.api.FlywayException: Validate failed:问题解决办法

在idea中找到数据库，如下图所示：双击flyway出现执行：mvn flyway:migrate 历史记录。把最新执行看到执行失败的那条记录删掉，并提交。然后重新运行mvn flyway:migrate命令即可成功。...

2020-03-21 16:32:58 14179 2

原创北京大学生物信息学课程笔记（第一二周课程笔记）

课程笔记第一课第二课第一课课程涉及什么内容序列比对算法，如何在大量的基因序列中找到与我最相似的–blast序列统计工具如何基于已知数据预测未知通过马尔可夫模型预测如何回帖到参考基因组鉴定一个人的遗传变异如何计算基因表达差异案例实践什么是生物信息学染色体内的基因组就像是人的说明书四个碱基ATCG，so simple， yet so mysterious.生物序...

2020-03-20 17:20:29 1262

原创运行ROCR出现错误: 无法载入程辑包‘caTools’，package or namespace load failed

环境是win10+R3.5.3问题已解决，报错如下载入需要的程辑包：gplots Error: package or namespace load failed for ‘gplots’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]): 不存在叫‘caTools’这个名字的程辑...

2020-03-15 16:30:26 11129 2

原创 R语言安装多个版本和多版本Rstudio管理教程

今天运行R环境来画图，出现了几个问题。来记录一下。如何安装和管理R的多个版本首先如果是需要最新的R版本的话，可以从清华镜像下载（速度也快）https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/若需要旧版本，则可以从这下载https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/那么如何进行管理呢，第一步，点击菜...

2020-03-15 16:09:45 14374 3

xjw的博客