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空间组数据处理
文章平均质量分 68
主要专注跨物种脑科学的单细胞空间组数据的处理学习
木与长清
基因组学小菜鸟勇敢冲击单细胞空间组!我爱工作!
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scanpy读取10x单细胞数据
利用Python中scanpy包导入10x genomics单细胞数据原创 2024-05-22 16:09:28 · 614 阅读 · 0 评论 -
从GEO单细胞数据创建AnnData对象
从基本的单细胞数据创建anndata对象进行下游分析原创 2024-05-13 11:11:27 · 638 阅读 · 1 评论 -
安装CPU版本的Pytorch以及依赖库
最近需要用到深度学习的一些算法工具,奈何电脑上并没有条件配置GPU环境,大多数深度学习教程都是基于GPU环境搭建,于是记录一下CPU配置的过程。torch_scatter,torch_sparse,torch_cluster,torch_spline_conv是四个依赖库,可以按需安装。另外我还需要安装pytorch_geometric包,注意最新的版本需要基于Python 3.8以上的版本。首先是基础的torch包的安装,安装之前最好更新一下pip库。检查环境下安装的所有包,是否存在版本冲突。原创 2024-05-11 18:08:23 · 579 阅读 · 1 评论 -
利用Photoshop进行单细胞配准
通过Ps实现快速的单细胞图片配准原创 2023-08-10 11:12:21 · 135 阅读 · 1 评论