caffe处理医学图像遇到的问题

最新推荐文章于 2018-10-08 15:29:32 发布
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分类专栏： medical image processing caffe/tensorflow
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    没有过多的甄别的选择了caffe框架来实现一项关于脑部MR图像的分割任务，遇到了不少问题。win7下安装了caffe，然后编写protxt文档，处理数据集。卡在了处理数据集这个上面很久，因为caffe中需要将数据写成lmdb或者leveldb格式，lmdb和leveldb对应的是两种类型的数据库，其中lmdb是基于二叉树的数据库，leveldb是key-value型数据库。都具有简单、读写高效的特性。
    一是修改convert_imageset.cpp，使得它能够读入raw格式数据，二是继续调研caffe是否允许其它方式导入数据，是否存在其它数据导入接口的可能性，三是换框架，经查证keras能够直接支持raw的处理，这里又不得不抛出一个新问题给小白的我了，不同框架的选择对于应用型研究是否最简单易于实现的便是最佳呢？不同框架会对本身网络实现的性能有什么影响呢？

Lumi555
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用自己的数据进行CaffeNet训练模型
02-02
win7环境下，用自己的数据进行CaffeNet训练模型，亲测可行！
医学图像数据处理流程以及遇到的问题
奇点Peter
12-08 476
data_prepare.py 的 crop_with_annotation 以及 build_annotation_patches 方法。data_prepare.py 的 build_normal_patches_image 方法。data_prepare.py 的 build_data_csv 方法。data_prepare.py 的 align_xml_svs 方法。输出目录 tumor_mask_level1。输出目录 tumor_patch_img。输出目录 tumor_patch_img。
ImageNet和CNN可以帮助医学图像的识别吗?
03-08 1万+
对于医学图像而言，得到大规模的训练数据是比较不容易的，那么可否使用Transfer Learning利用现成的ImageNet的图像来帮助医学图像的识别呢？ImageNet里面的图像（二维，彩色）没有医学图像，包含一些诸如鸟类、猫、狗、直升机等物体的识别，与医学图像（二维或三维，非彩色）相差很大。如果回答是肯定的话，是一件令人非常振奋的事情。
【caffe速成】caffe图像分类从模型自定义到测试
hacker_long的专栏
10-08 1825
文章首发于微信公众号《与有三学AI》 【caffe速成】caffe图像分类从模型自定义到测试 这是给大家准备的caffe速成例子 这一次我们讲讲 Caffe 这个主流的开源框架从训练到测试出结果的全流程。到此，我必须假设大家已经有了深度学习的基础知识并了解卷积网络的工作原理。 相关的代码、数据都在我们 Git 上，希望大家 Follow 一下这个 Git 项目，后面会持续更新不同框架下...
基于深度学习的CT图像肺结节自动检测技术一——数据预处理（归一化，数据增强，数据标记）
红叶谷 wsp_1138886114的博客
09-22 3万+
一、读取图片dicom —>截取像素 —>归—化(0,1) —>存储为png 二、图像增强：（旋转，平移） pip install SimpleItk # 读取CT医学图像 pip install tqdm # 可扩展的Python进度条，封装任意的迭代器 tqdm(iterator)
使用caffe处理非图像回归问题的例子.zip
04-14
【项目资源】：包含前端、后端、移动开发、人工智能、物联网、信息化管理、数据库、硬件...【沟通交流】：有任何使用上的问题，欢迎随时与博主沟通，博主会及时解答。鼓励下载和使用，并欢迎大家互相学习，共同进步。
从指定路径读取图像文件、利用OpenCV进行图像处理，以及使用Caffe框架进行深度学习预测的过程
最新发布
04-18
OpenCV（Open Source Computer Vision Library）是一个跨平台的计算机视觉库，它包含了众多图像处理和计算机视觉的算法。要读取图像，可以使用`cv2.imread()`函数，它接受一个字符串参数，即图像的路径，返回一个...
caffe- openpose图像处理插件.zip
07-01
《Caffe与OpenPose图像处理插件：深度学习在视觉计算中的应用》 在现代计算机视觉领域，深度学习已经成为核心技术之一，特别是在图像处理和识别任务上。Caffe（Convolutional Architecture for Fast Feature ...
caffe训练图像分类的资源
03-21
通过结合Caffe的高效模型训练能力和OpenCV的图像处理功能，你可以构建一个能够准确识别猫、狗、卡通人物和花的深度学习模型。这个过程将涵盖数据预处理、模型构建、训练以及性能评估等多个重要环节，是深入学习和...
高性能图像处理系统1
08-04
高性能图像处理系统（HPIPS）是一个以C++为基础的集成解决方案，专为图像处理任务设计，它结合了多种库和框架，以提供一个全面、高效且用户友好的开发环境。该系统的目的是简化图像处理的各个环节，从算法设计到工程...
【有三公开课】caffe图像分割项目实战
hacker_long的专栏
09-12 368
有三 · 公开课本课程中，将基于caffe这个深度学习开源框架，完整地讲述一个图像分割项目中，数据的准备，caffe的环境配置，caffe的源码分析与修改，分割网络的设计...
三维卷积：全景图像Spherical CNNs（Code）
wishchinYang的专栏
06-04 1万+
         卷积神经网络（CNN）可以很好的处理二维平面图像的问题。然而，对球面图像进行处理需求日益增加。例如，对无人机、机器人、自动驾驶汽车、分子回归问题、全球天气和气候模型的全方位视觉处理问题。         将球形信号的平面投影作为卷积神经网络的输入的这种Too Naive做法是注定要失败的，Cnns的巨大成就来源于局部感受野的权值共享，而对于球形图像，若要使用CNNs直接共享，构建...
caffe路径正确，却读不到图片
杨航的专栏
12-26 1390
调试caffe，用已有的网络训练自己的数据集的时候（我这里做的是二分类）。在生成均值文件之后，开始train，发现出现了这个问题。 1，路径正确，却读不到图片。 [db_lmdb.hpp:15] Check failed: mdb_status == 0 (2 vs. 0) No such file or directory   我发现这check failed的上面有一句
深度学习下的医学图像分析
xiangz_csdn的博客
07-02 4万+
本文由图普科技编译自《Medical Image Analysis with Deep Learning 》， 在系列的第一篇文章中，我们介绍了一些使用OpenCV和DICOM图像基础知识进行图像处理的过程。在系列的第二篇文章中，我们将从“卷积神经网络”的角度讨论深度学习。在系列的第三部分，我们将利用Kaggle的肺癌数据库，重新查看肺癌DICOM图像中的关键内容和信息，并且利用Kera开发一个肺癌预测模型。
【深度学习论文】：U-Net
热门推荐
谢军的博客
05-03 7万+
U-Net在深度学习应用到计算机视觉领域之前，人们使用 TextonForest 和 随机森林分类器进行语义分割。卷积神经网络（CNN）不仅对图像识别有所帮助，也对语义分割领域的发展起到巨大的促进作用。语义分割任务最初流行的深度学习方法是图像块分类（patch classification），即利用像素周围的图像块对每一个像素进行独立的分类。使用图像块分类的主要原因是分类网络通常是全连接层（full
基于caffe的图像分类(3)——修改网络并训练模型
小咸鱼_的博客
06-15 1万+
前面做好了lmdb和均值文件，下面以Googlenet为例修改网络并训练模型。 我们将caffe-master\models下的bvlc_googlenet文件夹复制到caffe-master\examples\imagenet下。（因为我们的lmdb和均值都在这里，放一起方便些） 打开train_val.txt，修改： 1.修改data层： layer { name: "da
caffe for Windows图像分类训练、测试实例
John_kai的博客
07-10 1964
数据集使用的是kaggle上的猫狗数据集。 在编译好的caffe->data目录下新建文件夹cat and dog，数据集中的train和test文件夹放到data目录下。 第一步：生成train数据的标签文件，根据图片名生成对应的标签，这里，0是cat，1是dog程序如下：# -*- coding: utf-8 -*- """ Created on Sun Jul 9 20:26:20 20
深度学习文章3：将自己的图像数据转换成caffe需要的db(leveldb/lmdb)文件
莫欺丶Miss航的博客
11-30 6806
将自己的图像数据转换成caffe需要的db(leveldb/lmdb)文件在搭建好caffe环境之后，我们往往需要对自己的图像数据进行训练/测试，我们的图像数据往往时图片文件，如jpg，jpeg，png等，然而在caffe中我们需要使用的数据类型是lmdb或leveldb，例如：在之前测试MNIST数据集《 深度学习文章2：使用MNIST数据集验证Caffe是否安装成功 》时，我们运行脚本creat
caffe训练图片分类遇到一些问题
helloworldding的博客
08-01 2061
问题一： 首先修改图片的大小：在shape中，第二个dim个通道数，第三，四个为长宽，最主要是卷积层中num_output卷积核的个数是根据图片的大小进行计算的，对于灰色图像来说卷积核个数最多可以为 (64 +2 * pad + stride) - kernel_size  ，所以num_output值最多不能超过这个值，要不然会报错。 问题二：caffe在训练自己分类的图像时，由于参数
Caffe深度学习图像识别分类去重软件及源码
- 神经网络的基本单元和层次结构，例如卷积神经网络（CNN）在图像处理中的应用。 - 训练深度学习模型的过程，包括前向传播、损失函数、反向传播和梯度下降等。 2. MFC开发基础: - MFC（Microsoft Foundation ...
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