ReaxFF反应力场计算开发

ReaxFF 是新一代的分子力场，能够模拟化学反应过程中键的形成和断裂，从而更好地捕捉到分子间的相互作用。目前，ReaxFF MD 模拟方法已应用于复杂反应过程如热解、氧化、催化反应等反应机理的研究。此外，ReaxFF 还可以用于研究氧气与真实硅石表面的相互作用，以及有机分子热分解的 LAMMPS 模拟等研究。总之，ReaxFF 反应力场是一种具有广泛应用前景的分子力场，能为分子动力学模拟提供更为准确的描述和预测。此外，ReaxFF 还具有模拟速度快的优点，能够处理较大体系的化学反应过程，为材料科学、化学工程等领域的研究提供了有力的工具。
ReaxFF 反应力场计算开发与应用
ReaxFF 基础理论

1. ReaxFF 反应力场概述
   1.1. ReaxFF反应力场的发展历程和基础
   1.2. ReaxFF反应力场参数分枝与详解
   1.3. ReaxFF反应力场的应用领域

ReaxFF基础入门
2. ReaxFF ReaxFF 反应力场基础入门
2.1. 所需输入重要文件详解包括 control, geo, ffield等文件
2.2. 结合实例，讲解输入文件命令行，输出文件
2.3. ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看
2.4. ReaxFF反应力场运行软件安装和配置(standalone ReaxFF,LAMMPS)
2.5. ReaxFF 反应力场的选取和准备

ReaxFF 计算软件
3. 分子建模，可视与 分子建模，可视与 计算 软件
3.1. 建模软件gview, material studio
3.2. 可视软件molden, VMD, OVITO
3.3. ReaxFF计算软件 standalone ReaxFF, LAMMPS
3.4. ReaxFF 特殊功能介绍：改变温度体积，产生特定比例混合物，设置电荷，限制优化和扫描，添加删除分子，结果查看和分析等

ReaxFF 计算软件
4. Lammps Lammps 实例操作
4.1. LAMMPS运行设置和后处理程序软件ChemTraYzer等的安装和配置
4.2. Lammps燃烧过程简单例子（模拟和分析）
4.3. LAMMPS高级算例：模拟化学摩擦过程（CMP）：建模，loading和shearing过程模拟，结果分析等

ReaxFF 进阶实例
5. ReaxFF ReaxFF 进阶实例操作 ， 理解 计算 模拟的 过程及 物理意义
  实例操作： 实例操作： 溶液中的质子转移 (JPCB,JPCL 文献) )
5.1. 建立初始模型：重点注意事项
(minimization->nvt->compress->npt->nvt)
5.2. 输入文件设置, 开启输出unfolded坐标文件
5.3. 模拟步骤：能量最小化，压缩，系综平衡等
5.4. VMD查看结果分析：msd，扩散系数，rdf，sdf, 质子追踪等

ReaxFF 进阶实例
实例操作： 实例操作： 碳化硅表面石墨烯的生长（ Chem. Mater 文献）
5.5. 建模与输入文件，表面选取与准备
5.6. 热分解法生长石墨烯，删除表面硅
5.7. cvd法生长石墨烯，添加乙炔分子
5.8. 5.8. 可视评估石墨烯质量 （模拟结果统计与可视化）

ReaxFF 高级实例
6. 量子化学 软件 CP2K 入门
6.1. CP2K基本功能介绍
6.2. CP2K的下载和安装
6.3. CP2K的结构文件的建模
6.4. CP2K输入文件讲解和建立
6.5. CP2K输出文件介绍和可视化转化

ReaxFF 高级实例
7. CP2K 结构优化、过渡态搜索和力场开发实例
7.1. CP2K研究有机分子在固体表面的吸附
7.2. CP2K过渡态计算以及结构和能量提取
7.3. ReaxFF反应力场开发所需文件详解
7.4. 提取CP2K计算结果实现ReaxFF训练集的构建
7.5. ReaxFF力场验证