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RSS订阅翻译 机器学习中的世代、迭代和批大小
翻译来源：https://medium.com/@ewuramaminka/epoch-iterations-batch-size-11fbbd4f0771机器学习(ML)中的一些术语很容易被误解或混淆。为什么呢我的观察是：大部分ML书籍或教程都没有花时间在解释这些名词上面，而是更多的篇幅在他们讨论的主题上，这样会让大部分人混淆。在这篇短文里面，我会花时间简单讲解一下ML中的Epoch和Iteration的主要区别。这里已经假设各位读者有人工神经网络的基础，而且并不针对某一种特殊的ML种类。在我解释
2020-11-14 10:31:11
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原创 python中利用biopython和dssp提取pdb文件中的二级结构
以CASP11数据集为例，选取domain中的pdb数据作为转换：在python中，安装biopython包和dssp包pip3 install biopythonconda install -c salilab dssppython脚本如下，可以提取所有sequence和ss的信息到同一个文档：from Bio.PDB import DSSP, PDBParserimport osdir='/***/casp11.domains/'list=os.listdir('/***/casp
2020-08-19 15:45:04
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原创 Centos7 安装Anaconda和GPU版本TensorFlow
写在前面，在安装之前要先考虑版本对应的问题如何查看GPU/CUDA/CUDNN/Python/Tensorflow/Anaconda的对应版本呢？我使用的GPU是P4000，驱动安装的是NVIDIA-Linux-x86_64-450.57.run，配置了CUDA10.1，cudnn-10.1-linux-x64，Python3.8.3，Anaconda最新版，tensorflow2.2.0本人初学，网上有一些对应的资料可以查，但是新版的不太好找到，所以我是先装了anaconda和tensorflow，
2020-08-15 13:38:57
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翻译 禁用 tracker-miner-fs 的方法
转自：https://askubuntu.com/questions/346211/tracker-store-and-tracker-miner-fs-eating-up-my-cpu-on-every-startupecho -e "\nHidden=true\n" | sudo tee --append /etc/xdg/autostart/tracker-extract.desktop /etc/xdg/autostart/tracker-miner-apps.desktop /etc/xdg/a
2020-08-14 22:02:45
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原创 python遍历提取文件夹里的某几行内容并去除所有数字代码
import osimport relist=os.listdir('C:/地址')print(list)"""##合并文件夹里的所有txt文件for i in list: print(i) with open("C:/地址/"+i) as f: for line in f.readlines(): with open("C:/地址/all.txt","a") as p: p.write(line)""
2020-08-12 21:37:29
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原创 Gromacs&g_mmpbsa安装教程
环境：linux CentOS 7.3 安装均为单机版本，默认安装，且使用二进制文件。1、下载安装cmake-3.14.1不好使用yum直接安装cmake因为yum下载的cmake版本过低，不适用于gromacs的编译cmake官网下载安装包https://cmake.org/download/# wget https://github.com/Kitware/CMake/release...
2019-04-11 12:11:24
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转载 Linux系统之路——如何在CentOS7.2安装R和RStudio(Server)--转载
https://www.cnblogs.com/Yiutto/p/5958523.html
2019-04-11 11:35:05
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原创 生信初步|PyRosetta蛋白质多肽链折叠
学习资料教程（需要翻墙）：http://www.pyrosetta.org/tutorials ，http://www.meilerlab.org/index.php/jobs/resources值得参考的博客博主：https://www.jianshu.com/u/e0610017c276在线计算平台：Robetta（多肽数>27） http://robetta.bake...
2019-02-16 13:03:05
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原创 分类树的应用--电信数据
决策树决策树的构建概括为3个步骤：特征选择、决策树的生成和决策树的修剪特征的选择信息增益：在划分数据集之前之后信息发生的变化成为信息增益，获得信息增益最高的特征就是最好的选择。香农熵的计算方式：l(xi)=−log2p(xi)l(x_i) = -log_2p(x_i)l(xi)=−log2p(xi)H=−Σp(xi)log2p(xi)H =-\Sigma p(x_i)log_2p...
2019-02-16 11:20:34
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原创 Pyspark学习笔记1——配置环境并计算pi测试
Pyspark学习笔记（一）环境搭建在linux的CentOS 7.3中，首先要配置好JDK和python。1.JDK和Python3配置Jdk的下载地址，注意需要先点击同意条款的按钮。http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html$ wget https://down...
2018-12-01 20:30:42
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空空如也
空空如也
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