记录我所遇到的关于nnunet的问题(linux和nnunet都是新手)
1.使用公司服务器安装anaconda,conda安装到固态上,环境建到硬盘上
2.环境安装时装pytorch竟然出现问题,更换了镜像依然不行,
最后找到torch找新的安装命令,torch官网,查看旧版本页面,以下命令可以正常安装
之后按照博客
https://blog.csdn.net/weixin_42061636/article/details/107623757
进行学习和操作,
其中json文件制作时自己写的
在nnunet数据校验中报label像素和json内容不一致,更改数据,统一像素。之后又报图像和标签几何形状不一致,
都统一为图像的属性包括中心点和体素间距。nnunet重新校验,时间较长
主要检查以下几项:
等待
label和test校验之后,开始crop并保存到cropped文件夹