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原创 群体遗传 | haplotype block | HaploBlocker使用
利用HaploBlocker软件分析haplotype blocks
2022-03-25 12:10:33
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原创 多倍体中亚基因组优势的潜在机制
基因组研究和分子遗传学的一个主题问题:异源多倍体物种中亚基因组优势的潜在机制。异源多倍体是由两个或多个二倍体祖物种杂交形成的,通常经历了亚基因组优势(亚基因组显性),即亲本基因组(亚基因组)中的其中一个具有更高水平的基因表达,并最终比其他亚基因组有保留更多的基因。在一些异源多倍体中,基因附近的低转座因子(TE)丰度与占优势的亚基因组有关,但TEs不太可能是导致亚基因组表达优势的唯一原因。
2022-03-20 17:11:29
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原创 群体遗传 | haplotype block | HaploBlocker参数介绍
单倍型块( haplotype block)是连续基因组区域的一系列遗传变异位点的组合,这种基因组区域通常表现为高连锁不平衡、低重组。HaploBlocker是一个R包,在群体遗传分析中,用于寻找haplotype block (单倍型块)。
2022-03-17 17:32:20
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原创 群体遗传 | haplotype block | HaploBlocker安装
HaploBlocker是一个R包,在群体遗传分析中,用于寻找haplotype blocks (单倍型块)
2022-03-16 21:42:57
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