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咩小饬
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可变剪切:基因表达的神奇开关(MISO)
要理解可变剪切,我们首先需要了解基因的基本构造。基因是DNA中的一段序列,它指示细胞如何制造蛋白质。在基因表达的过程中,DNA被转录成mRNA,而mRNA则是细胞生产蛋白质的蓝图。然而,这个过程并不是简单的“从头到尾”的复制,而是经过了一些“编辑”步骤。外显子和内含子。外显子是编码蛋白质的片段,而内含子则是需要被去除的“无用”片段。通常情况下,mRNA在被翻译成蛋白质之前,内含子会被剪掉,外显子拼接在一起。但在可变剪切中,这个拼接过程可以产生不同的组合方式。原创 2024-09-14 04:35:27 · 612 阅读 · 0 评论 -
记录一次xpclr检测中报错(“No permission to write in the specified directory: {0}“)
看到这个问题,一头雾水,没有写入权限。原创 2024-02-24 12:49:25 · 461 阅读 · 1 评论 -
snpEff变异注释的一点感想
SnpEff(Snp Effect)是一个用于预测基因组变异(例如单核苷酸变异、插入、缺失等)对基因功能的影响的生物信息学工具。它可以帮助研究人员和生物信息学家分析基因组变异并预测这些变异可能对基因产生的影响。原创 2023-08-20 02:40:00 · 436 阅读 · 0 评论 -
重测序之快速比对(速度与服务器的配置挂钩。)
基本上每一个参数都是重点没有可浪费的,每一步都是重点。充分理解screen就明白了。都不喜欢讲想法,那就看原理。原创 2023-07-19 06:20:18 · 103 阅读 · 0 评论 -
选择信号检测--基于单体型haplotype的选择信号的检测(iHS)
(iHS)用选择信号检测方法,做了基于单倍体型haplotype的选择信号检测原创 2023-05-10 17:33:50 · 1019 阅读 · 28 评论 -
基于爬虫实现基因功能批量查找
python代码实现功能基因查找,genecard,自动化原创 2022-12-26 16:24:45 · 763 阅读 · 0 评论 -
snp芯片染色体分型(染色体切割)
实现:snp芯片map文件依据染色体数目分割成多个文件原创 2022-12-14 12:46:38 · 172 阅读 · 0 评论 -
Beagle填充之坑ERROR: REF field is not a sequence of A, C, T, G, or N characters at
No genetic map is specified: using 1 cM = 1 MbERROR: REF field is not a sequence of A, C, T, G, or N characters at 1:47721496 [1]ERROR: REF field is not a sequence of A, C, T, G, or N characters at 1:16800804 [2]ERROR: REF field is not a sequence of A,原创 2022-11-11 15:39:18 · 1094 阅读 · 7 评论 -
简单做个Beagle
beagle做基因定相与填充转载 2022-11-07 22:42:50 · 1198 阅读 · 3 评论 -
evolview进化树美化(2.条形图)
Please email us (Evolgenius Team) if you have any questions; attach your datasets and trees if necessary.BarsIndexOverviewModifiersExamplesShow data valueChange display order of stacked barsOverviewBar charts will be displayed next to leaf label转载 2020-08-02 19:41:36 · 1907 阅读 · 3 评论 -
evoliew进化树的美化(1.线图)
例子范例1,“ ad”:branch colorhuman,mouse red ad示例2,“前缀”:ch red prefix示例3,“后缀”:n red prefix示例4,“ toroot”:human red toroot原创 2020-08-02 19:30:56 · 530 阅读 · 1 评论 -
生信入门
题前语: 面对未知的前方每个人都可能些许迷茫,但是迷茫归迷茫,可千万不要忘记奋力奔跑。欢迎各位看到本篇内容的学弟学妹以及朋友们,我叫咩小饬,以下内容如有不足欢迎指出。1. Linux基础 先说说为什么需要学习linux吧,因为在一个数据时代的今天,我们日常生活中接触到的数据越来越多,然而在很多行业首先你需要处理数据使用计算机运行数据对计算机的要求也是极为苛刻,然而windows与linux最大的差异就是性能问题,目前大火的大数据基本都是在linux系统下运原创 2020-07-25 12:26:40 · 1437 阅读 · 2 评论 -
学习笔记:matplotlib数据可视化
先保存在这里,还没写完。。。import numpy as npfrom matplotlib import pyplot as pltx=np.linspace(-10,10,1000)y1=np.linspace(12,45,1000)y2=2*x**2+1plt.figure()#figsize可调节页面尺寸plt.plot(x,y1,)plt.plot(x,y2,colo...原创 2020-03-04 14:18:46 · 248 阅读 · 0 评论 -
windows系统启用win虚拟机hyper-v
在桌面建立文件"启用win虚拟机.cmd"将下面代码复制粘贴。pushd "%~dp0"dir /b %SystemRoot%\servicing\Packages\*Hyper-V*.mum >hyper-v.txtfor /f %%i in ('findstr /i . hyper-v.txt 2^>nul') do dism /online /norestart /ad...原创 2020-04-02 17:45:25 · 179 阅读 · 0 评论 -
那些在vcftools安装上踩的坑
@[TOC]那些在vcftools上踩的坑那些在vcftools安装上踩的坑近期由于学习需要所以需要安装vcftools做基因比对分析。然后的然后就各种·问题来了…vcftools在kail linux 系统下安装老生常谈的话题就直接上代码吧。// 这个想必大家都很熟悉tar -zxvf vcftools_0.1.13.tar.gz解压后就是这个样子然后,,嗯,,礼貌性的对它ma...原创 2019-10-23 13:53:29 · 2128 阅读 · 0 评论