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RDKit
文章平均质量分 61
YnagShanwen
这个作者很懒,什么都没留下…
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分子描述符
写的非常通俗易懂,good什么是分子描述符?所谓分子描述符,是指分子在某一方面性质的度量,既可以是分子的物理化学性质,也可以是根据分子结构通过各种算法推导出来的数值指标一般选择合适分子描述符的要求(1)具有结构解释性;(2)与至少一种性质具有良好的相关性;(3)具有区分异构体的优势;(4)能够应用于局部结构;(5)独立性好;(6)简洁;(7)不是基于实验性质;(8)与其他描述符不相关;(9)可以有效构建;(10)使用熟悉的结构概念,(11)具有正确的大小依赖性;( 12)随结构的改变而变化。分子原创 2021-05-14 18:44:57 · 5678 阅读 · 1 评论 -
RDKit原子和键的环性质
1. 引入所需库#! /usr/bin/python# coding: utf-8# rdkit 操作分子对象from rdkit import Chem2. test 分子smi='[C:0]1-[C:1]-[C:2]1-[C:3](-[CH2:4])(-[CH:5])'mol = Chem.MolFromSmiles(smi)atoms = mol.GetAtoms()bonds = mol.GetBonds()3. 获取分子中所有的环信息atom.IsInRing() #原创 2021-05-08 16:29:51 · 1206 阅读 · 0 评论