分子描述符

写的非常通俗易懂,good

什么是分子描述符?

所谓分子描述符,是指分子在某一方面性质的度量,既可以是分子的物理化学性质,也可以是根据分子结构通过各种算法推导出来的数值指标

一般选择合适分子描述符的要求

(1)具有结构解释性;(2)与至少一种性质具有良好的相关性;(3)具有区分异构体的优势;(4)能够应用于局部结构;(5)独立性好;(6)简洁;(7)不是基于实验性质;(8)与其他描述符不相关;(9)可以有效构建;(10)使用熟悉的结构概念,(11)具有正确的大小依赖性;( 12)随结构的改变而变化。
在这里插入图片描述

分子描述符计算工具

当前已有许多用于计算分子描述符的商业和免费提供的软件。其中一些是专门为分子描述符的计算而开发的(如:BlueDesc、CDK Descriptor 、DRAGON、MODEL等),也有一些QSAR软件具有计算分子描述符的功能(如: CODESSA Pro, Discovery Studio, Sybyl, MOE),此外,还有一些开源库,例如JOELib、Chemistry Development Kit (CDK)也提供了计算分子描述符的功能。

分子描述符的计算可以通过Dragon、PowerMV等专门的描述符计算软件实现,也可使用Sybyl、Cerius2等分子模拟软件包中有关描述符计算的模块。

分子描述符计算软件比较多,这里不一一赘述,简单列举一下:

Dragon、MoDEL、MolGen、Cerius2、Sarchitect、PreADMET、ADRIANA.Code、ADMET Predictor、MOE、Joelib、ADAPT、SYBYL、PowerMV、CODESSA、Pipeline Pilot、SARNavigator等等

化合物的极性表面积(PSA)是分子表面极性部分的面积值的总和。极性部分通常在诸如氧或氮的杂元素周围
范德华表面积
官能团描述符 FGCD
将键型列平方或三次方,增强反应诱导能力(反应性)的表达
价电子指原子核外电子中对参与化学反应有重要意义的电子。

化合价是原子间相互化合时:
无机物化合——原子得失电子数
有机物——共用电子对偏移的数目

反应

碰撞+静电吸引+自由基电子的结合

  • 5
    点赞
  • 24
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值