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RSS订阅原创 处理野生小麦组织的表达矩阵
原始文件：153个SRA文件一、从SRA到fastaqfor f in $path/ERR*;do echo $fdone
2022-04-12 12:06:17
550
原创 WGCNA
WGCNA分析，简单全面的最新教程 - 简书 (jianshu.com)https://www.jianshu.com/p/e9cc3f43441d一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) - 云+社区 - 腾讯云 (tencent.com)https://cloud.tencent.com/developer/article/1516749安装WGCNA编辑包出现如下问题怎么解决？ - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)https://www.omicsclass.com/q.
2022-03-10 22:05:56
660
原创 利用python提取基因cDNA长度，exon数量，pep长度和PI
gff是以 "\t" 为分隔符的存储9列信息的文本文件，格式如下：chr1H PGSBv2.28112019 gene 222337 227461 3053.527 + . ID=Horvu_AKASHIN_1H01G000500;OGID=OG0028375;AHRD Description=Fatty acyl-CoA reductase;AHRD Quality Score=3;TE-related=0;PFAM ID=PF03015,PF0
2022-02-25 20:19:26
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原创 如何实现每行最后一个指定字符转换
如有以下414.txt文件shdgaghds_ghsdfak_fgs_1hdgfajfdg_SDa_sDFD_dFA21SADHFJ_SA_Dfsd_zxcv_2_1jasdbja_DS_FvadvF_dfvE_dvdsahh_Vae_zxva_dv_12_dvadsahfa_agf_veqr_afd如何实现将最后一个“_”替换为“ ”cat 414.txt | while read line; do left=${line##*_}; right=${line%_*}; echo
2021-12-21 12:42:07
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原创 从SRA下载数据
搜索有关大麦的所有数据，点击send to ，输出File，在csv文件中筛选目标的seq找到项目ID或者study accession，在SRA Explorer中搜索，下载目标项目的脚本一般选择Bash script for downloading FastaQ files，直接下载即可需要使用curl软件#!/usr/bin/env bashcurl -L ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR144/099/SRR144670...
2021-12-07 20:36:27
882
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空空如也
空空如也
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