Python贝叶斯优化工具包COMBO安装步骤

COMmon Bayesian Optimization Library ( COMBO )
Bayesian optimization has been proven as an effective tool in accelerating scientific discovery. A standard implementation (e.g., scikit-learn), however, can accommodate only small training data. COMBO is highly scalable due to an efficient protocol that employs Thompson sampling, random feature maps, one-rank Cholesky update and automatic hyperparameter tuning.
本文主要介绍Python3.x.x版本（即COMBO3）的安装。

1. Linux系统

本文讲解的安装方法适用于Linux系统，因此需要先确保有Linux系统，因为在Windows下进行安装可能会存在问题。主要有两种方法：

1. 在Windows下安装虚拟机（推荐使用VMware，交大学生可参考上海交通大学VMware学术计划 进行安装），并安装Ubuntu系统（免费的图形界面，对新手比较友好）。具体的安装流程可以参考其它博主的相关文章，这里不详细介绍。
2. 使用超算平台。

2. Anaconda安装

Anaconda可以便捷获取包并且对包能够进行管理，对环境也可以进行统一管理。

1. Anaconda安装包的下载
   登录Anaconda官网后，依次点击
   Get Started >> Install Anaconda Individual Edition >> Download >> 64-Bit (x86) Installer (550 MB)
   
   
   
   
2. Anaconda的安装
   上述过程可以在windows中下载，随后移动到虚拟机 / 上传到超算平台，也可以直接在虚拟机中安装的Ubuntu系统直接打开网页进行下载。
   随后在Linux系统下，在安装包所在位置打开CMD窗口（虚拟机情况下，在安装包文件夹空白处右键打开；超算平台则需要cd到当前文件夹下），输入以下指令：

[ID@localhost]$ bash Anaconda3~.sh

注：Anaconda3~.sh 指的是之前下载的安装包（.sh文件）。
按照提示进行安装，中间需要输入yes/no的均输入yes。
安装之后**重启CMD窗口**：
输入conda，有版本号输出即说明Anaconda安装成功。

3. 利用conda指令安装COMBO的依赖包

COMBO提到的依赖包如下图所示：

依次使用conda指令安装即可：

[ID@localhost]$ conda install scipy
[ID@localhost]$ conda install cython
[ID@localhost]$ conda install mpi4py

中间需要输入yes/no的均输入yes

4. COMBO的安装

打开CMD并进入到自己想要进行安装的文件夹下，输入如下指令：

[ID@localhost]$ git clone https://github.com/tsudalab/combo3.git
[ID@localhost]$ cd combo3
[ID@localhost]$ python setup.py install

最后，关于检测是否安装成功，首先在CMD窗口输入：

[ID@localhost]$ python

随后输入：

import combo

若无报错，则说明安装成功。

建议看看官方提供的例子,很有帮助。
建议只安装anaconda，不要安装过多的python版本，会出现调用错误。