WRF-Hydro编译与安装流程(Ubuntu)

凌度豪翼zero

已于 2024-10-02 14:00:25 修改

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文章标签： ubuntu linux

于 2024-08-09 03:02:35 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/zeroherowing/article/details/141040349

版权

一、设备环境说明

本设备环境：

操作系统：Windows11

虚拟机软件：Oracle VM VirtualBox 7.0

虚拟机系统：UbuntuOS 22.04

虚拟机配置：8核心，8G运行内存，50G存储空间，英文语言，用户名ling

注意：

使用的部分指令如vim等，如果仍未安装请自行使用apt-get install安装。
不同Linux系统指令和文件可能有所差异，本文仅供Ubuntu 22参考，跟随本文安装请注意替换用户名为自己的用户名。
在文件处理时你可能会遇到权限拒绝问题，请确保你有超级用户权限，被权限拒绝的指令请添加sudo，或者运行:

su

输入密码，保证你在整个过程都以超级用户的身份运行指令。

二、预备操作

准备文件（主要用于管理文件，可选）

创建两个文件夹，一个sources用来存放源文件，一个apps用于安装，这两个文件夹也可以放到一个新的文件夹project里。

mkdir /home/ling/project
mkdir /home/ling/project/sources
mkdir /home/ling/project/apps

这样以后，我们可以把两个文件的路径作为两个变量保存起来，后面要使用时完全不用重新打一遍。

apps=/home/ling/project/apps
sources=/home/ling/project/sources

需要使用路径/home/ling/project/sources/sample时，用$sources/sample代替之，apps同理。

安装编译软件

需要安装gcc, g++, gfortran和make

sudo apt-get install gcc g++ gfortran make

准备安装包

准备mpich, zlib, hdf5, netcdf4的源文件，netcdf4需要安装c和fortran两个版本。这些源文件可以从以下链接下载：

mpich:

https://www.mpich.org/static/downloads/4.1.2/mpich-4.1.2.tar.gz

zlib:

https://www2.mmm.ucar.edu/wrf/OnLineTutorial/compile_tutorial/tar_files/zlib-1.2.7.tar.gz

hdf5:

https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.12/hdf5-1.12.2/src/hdf5-1.12.2.tar.gz

netcdf4-c：

https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf-c/4.9.2/netcdf-c-4.9.2.tar.gz

netcdf4-fortran：

https://downloads.unidata.ucar.edu/netcdf-fortran/4.6.1/netcdf-fortran-4.6.1.tar.gz

使用wget即可下载：

wget -P $sources url #将url换成上述链接

指令运行样例：

在这里插入图片描述
这里我使用windows下载后通过共享文件夹上传到文件夹里，再移动到project文件夹里。

全部下载后，一共5个文件，文件目录示意图如下：
请添加图片描述

三、安装依赖库

进入sources目录，按顺序安装mpich, zlib, hdf5, netcdf4，下文将使用变量apps，如果未声明这个变量，应该在此之前声明为对应的位置，或者在使用时手动替换它。

另外，zlib、hdf5是netcdf4的依赖库，我们将这三个库都安装在apps/netcdf下，mpich安装在apps/mpich下。

安装mpich

解压源文件，可以手动输入文件路径，或者使用通配符 * 来减少输入，不过tar一次只解压一个文件，应该保证只和一个文件匹配。例如netcdf4*将匹配到netcdf4-c和netcdf4-fortran两个文件，tar指令将报错。

tar zxf mpich-4.1.2.tar.gz
tar zxf mpich* #两者运行一个即可

进入解压后的目录里，设置安装路径，然后编译并安装：

./configure --prefix=$apps/mpich
make
make install

编译和安装时间可能会很长，请耐心等待（后面几个依赖库也是）。
请添加图片描述

由于过程漫长，输出繁多，不再给出具体输出图

安装zlib

跟前面一样，解压后进入目录，运行：

./configure –prefix=$apps/netcdf
make
make install

安装hdf5

跟前面一样，解压缩后进入目录，运行：

./configure --prefix=$apps/netcdf --with-zlib=$apps/netcdf --enable-fortran --enable-cxx
make
make install

安装netcdf4

跟前面一样，解压缩后进入目录安装netcdf4-c，在编译之前，先写入一些环境变量：

export CPPFLAGS=-I/$apps/netcdf/include
export LDFLAGS=-L/$apps/netcdf/lib

然后再配置并编译、安装：

./configure --prefix=$apps/netcdf --with-hdf5=$apps/netcdf --disable-dap
make
make install

解压缩后进入目录安装netcdf4-fortran：

./configure --prefix=$apps/netcdf --with-hdf5=$apps/netcdf --disable-dap
make
make install

完成安装后apps文件夹示意图：
请添加图片描述

编辑环境变量

将mpich、hdf5、netcdf写入到环境变量，让wrf安装时可以获取。

首先使用vim编辑.bashrc

vim ~/.bashrc

按a进入编辑，添加这几行到末尾，然后按Esc结束编辑，再输入冒号，输入wq保存并退出：

export PATH=/home/ling/project/apps/netcdf/bin:$PATH
export PATH=/home/ling/project/apps/mpich/bin:$PATH
export NETCDF=/home/ling/project/apps/netcdf
export LD_LIBRARY_PATH=/home/ling/project/apps/netcdf/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export LD_LIBRARY=/home/ling/project/apps/netcdf/lib:$LD_LIBRARY_PATH