ZGY9542的博客

N4-乙酰胞苷（ac4C）是mRNA的转录后修饰，在mRNA稳定和调节中起主要作用。 ac4C修饰mRNA的工作机制仍不清楚，传统的实验既费时又昂贵。作者提出了一种基于极限梯度提升分类器的XG‑ac4C机器学习模型，用于ac4C站点的识别。 XG‑ac4C模型使用了ac4C位点中核苷酸的三核苷酸的电子离子相互作用假电位和电子离子相互作用假电位的组合。此外，使用Shapley加性解释和局部可解释的模型不可知性解释来理解特征的重要性及其对最终预测结果的贡献。获得的结果表明，XG‑ac4C优于现有的最新方法。..

K-mer特征提取one-hot编码 定义K-mer函数，把序列转换成密码子形式 def Kmers_funct(seq): X = [None]*len(seq) #若数据只有一个序列，可不用此定义 for i in range(len(seq)): #若数据只有一个序列，可不用此循环 a = seq[i] t=0 l=[] for index in range(len(a)): t=a[in