这里使用的是 itk-5.2.1 版本
Python的itk函数库使用 imread()
函数读取文件,可以根据文件名自动选择相关的类。例如:
import itk
nii_path = 'test.nii.gz'
nii_img = itk.imread(filename=nii_path)
imread()
函数存在于itk安装包的 support/extras.py 文件内,函数API为:
def imread(
filename: fileioType,
pixel_type: Optional["itk.PixelTypes"] = None,
fallback_only: bool = False,
imageio: Optional["itkt.ImageIOBase"] = None
) -> "itk.ImageBase"
从一个文件或序列中读取一个图像,并返回一个itk.Image。
参数:
- filename: 单个文件的路径、一个图像序列的文件列表或是一个DICOM图像序列的目录
- pixel_type: 加载时的图像像素类型
- fallback_only: 如果为 True,则首先自动推断图像像素的类型,并仅在推断失败时使用给定的 pixel_type
- imageio:
itk.ImageIOBase
驱动的实例,用来读取文件
返回值:
- image: 得到的
itk.Image
如果没有提供 pixel_type,则读取器将根据图像文件的图像类型实例化。图像的维度是从硬盘中存储的维度自动推断的。
如果提供的 filename 是一个文件夹,则该文件夹将被假设为 DICOM 序列的路径。如果确实是一个 DICOM 序列,则读取器会使用一个 itk.ImageSeriesReader
对象来读取 DICOM 文件名。
如果给定的 filename 是文件名的列表或元组,读取器会使用一个 itk.ImageSeriesReader
对象来读取文件。