全网最详细 Python如何读取NIFTI格式图像(.nii文件)和 .npy格式文件和pkl标签文件内容

在医学图像处理中,我们经常使用一种NIFTI格式图像(.nii文件),现在我们来看看

  1. 什么是.nii文件?
  2. 该如何读取.nii文件?

1. NIFTI格式图像

  1. 什么是NIFTI(Neuroimaging Informatics Technology Initiative)格式图像?
    在讲解什么是NIFTI格式之前,得先了解一下Analyze格式。Analyze格式储存的每组数据组包含2个文件,一个为数据文件,其扩展名为.img,包含二进制的图像资料;另外一个为头文件,扩展名为.hdr,包含图像的元数据。在fMRI的早期,Analyze格式最常用的格式,但现在逐渐被NIFTI格式所取代。Analyze格式主要不足就是头文件不能真正反映元数据。
    标准NIFTI图像的扩展名是.nii,也包含了头文件及图像资料。由于NIFTI格式和Analyze格式的关系,因此NIFTI格式也可使用独立的图像文件(.img)和头文件(.hdr)。单独的.nii格式文件的优势就是可以使用标准的压缩软件(如gzip)进行压缩,而且一些分析软件包(比如FSL)可以直接读取和写入压缩的.nii文件(扩展名为.nii.gz)。

  2. 为什么会出现NIFTI格式图像?
    原来的ANALYZE 7.5 format图像格式缺少一些信息,比如没有方向信息,病人的左右方位等,如果需要包括额外的信息,就需要一个额外的文件,比如ANALYZE 7.5就需

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