ggplot2初阶_散点图的排序和美化

上一节讲了散点图的画法，但是基于普通的画法根本无法应用于文章中，这节将其进行美化，并依照点的大小对其排序。

1. 排序

在ggplot2中有个默认的排序函数reorder，用法如下：

reorder(x,X,FUN=mean, decreasing=TRUE)

• x
  分类的变量，将被重新排序

• X

是一个向量，与x长度一样，x的每一层有唯一的子集，决定排序的顺序。

• FUN

可选的排序函数。如果指定了排序函数，将使用该函数来对变量x的水平（factor levels）进行排序；否则，默认使用变量本身的值进行排序。

• decreasing

一个逻辑值，用于指定是否按降序排序。

上次的点图可以把Pathway进行排序，就是把Pathway换成reorder(data$Pathway,data$Count,decreasing=TRUE)
未排序代码

library(ggplot2)
data<-read.csv("point.csv",header = T,row.names = 1)#读取数据
ggplot(data,aes(Count,Pathway))+
geom_point(aes(size=Generatio,colour=-1*log10(PValue)),stroke=3,shape=5)+
scale_colour_gradient(low="yellow",high="red")

排序代码

library(ggplot2)
data<-read.csv("point.csv",header = T,row.names = 1