galaxy 工具报错解决办法汇总

1. chaos工具

报错信息：

解决办法：

 更新numpy版本信息，依赖库一起安装

 2、MSISE工具

报错信息：

解决版本：

pip install msise00

3、IRI模型

报错信息：

解决办法：

pip install pillow

4、IRI工具

报错信息：

解决办法：

conda install scipy 

5、IRI工具

报错信息:

解决办法：

python 3.6里面缺少get_scheduler，需要安装python3.7或者python3.8 

6、IRI工具

报错信息：

解决办法：

安装cmake   ,fedora系统命令yum install cmake

7. PreASI_Fits

报错信息：

解决办法：

 

 

 

 

Fedora 系统对应安装如下： 

8 、报错：

解决办法：将108服务器pre_asi_png.ipynb 代码io.imread改为cv2.imread

9.报错：

UVI_pre_png.py 文件报错。

解决办法：pip install segmentation_models 

10、报错：

ASI_prepro_png.py文件报错。

解决办法： 

先贴出来正确代码如下， 

解决办法：

先查看 img的维数是2维还是3维度，如果是3维，将imread（a,b）参数b设置为0

11、报错：

 启用156服务器上python虚拟环境，不用base环境

13. 报错

 因为虚拟机上没有GPU。卸载掉gpu版本的tensorflow，留下cpu版本即可。

conda uninstall tensorflow-gpu

14.报错

解决办法：

因为当前在tensorflow2.0版本环境下，而tensorflow2.0版本去掉了placeholder

因此，需要修改tensorflow_backend.py文件

用：

import tensorflow.compat.v1 as tf

tf.disable_v2_behavior()

替换：

import tensorflow as tf

或者在tensorflow_backend.py里面找到

这类语句：

X=tf.placeholder(“float”) Y=tf.placeholder(“float”)
改为：

X=tf.compat.v1.placeholder(“float”)
Y=tf.compat.v1.placeholder(“float”)

15.报错

解决办法：

卸载pytorch，重新安装

conda uninstall torch

pip uninstall torch

conda install pytorch 

16.报错

nbcoverst下面的问题件内容有问题。

解决办法：因为anaconda 虚拟环境下的jupyter lab是正常的，nbconverts也是正常的。因此考虑，将nbconver解释器设置的路径为虚拟环境下。

vim /root/anaconda3/bin/jupyter-nbconvert

将第一行/root/anaconda3/bin/python  改为虚拟环境下python解释器 

 17.报错

MSISE工具报错原因是因为anaconda 复制过来的虚拟环境，相关解释器的路径都没有对应改过来。打开/root/anaconda3/envs/pytf36/bin/meson

 

将第一行改为当前的python解释器路径/root/anaconda3/envs/pytf36/bin/python3

或者重新安装IRI 

18. 报错

MSISE报错

解决办法： pip install msise00

20.报错

重装IRI 

21.PCA工具报错：unable to finish job

报错2：

 报错3：

先贴出正确代码： 

   pca = PCA(n_components=dimension)
    newX = pca.fit_transform(x1)
    print(type(newX))
    text1=newX.tostring()
    text='\n'.join(str(i) for i in newX)
    print(type(text))
    with open(outputloc,"w+") as f:
        f.write(text)  #这句话自带文件关闭功能，不需要再写f.close()

报错原因均是在标红部分。报错2和报错3均是因为打开文件方式不对，从而导致报错1.

数据类型说明：

newX是numpy数组 ，text1是bytes，text是str

报错1代码：

 pca = PCA(n_components=dimension)
    newX = pca.fit_transform(x1)
    print(type(newX))
    text1=newX.tostring()
    print(type(text1))
    text='\n'.join(str(i) for i in newX)
    print(type(text))
    with open(outputloc,"wb+") as f:
        f.write(text1)  #这句话自带文件关闭功能，不需要再写f.close()

报错2代码：

 pca = PCA(n_components=dimension)
    newX = pca.fit_transform(x1)
    print(type(newX))
    text1=newX.tostring()
    text='\n'.join(str(i) for i in newX)
    print(type(text))
    with open(outputloc,"w+") as f:
        f.write(text1)  #这句话自带文件关闭功能，不需要再写f.close()

报错3代码：

pca = PCA(n_components=dimension)
    newX = pca.fit_transform(x1)
    print(type(newX))
    text1=newX.tostring()
    text='\n'.join(str(i) for i in newX)
    print(type(text))
    with open(outputloc,"wb+") as f:
        f.write(text)  #这句话自带文件关闭功能，不需要再写f.close()

22. 远程调用GPU报错

ImportError: libssl.so.1.0.0: cannot open shared object file: No such file or directory

之前python3.6.4未有此报错，python3.7.5有报错。所以是python版本导致的问题，网上有说python3.7以后不支持openssl，引起的问题。

解决办法：由于本地base环境是python3.6.4，将工具远程调用代码运行在python3.6.4版本即可。修改xml文件里面python版本

 将python3改为python3.6.注意不能改为python3.6.4,否则报错。可能只能识别到python版本的2级

进一步思考：理论上，所以工具的python运行环境都可以独立起来。如python安装多个虚拟环境，在xml里面更改python命令为python虚拟环境路径：/root/anaconda3/envs/pytf36/bin/python 工具代码

23.远程调用工具报错

由于远程代码拷贝本地文件到GPU服务器时，只拷贝了目录下的文件，其他文件夹未拷贝，会导致缺少调用的包。因此需要将文件夹也拷贝过去

24. CHAOS6 global map 出现segment core dumpe

经试验，在ispace的正式环境10.10.138.156中，发现启用anconda虚拟环境的python3.7会报此错误，将工具xml文件里面调用命令改为python3.6即可解决出问题。但是在108服务器中python3.7却并不会报段错误，不知道问什么

25 . MODEL fusion 工具、gauss 过程插值工具等远程调用工具报错

重新安装paramiko库

conda install paramiko

会将相应的依赖库一起安装更新

具体操作：

在虚拟环境安装paramiko

将model_fusion_main.xml中的

python 3.6改完python 3.7 

26.上传文件总是报错，如404……

技术人员马利修改ispace后台数据库大小限制，成功 

27. AP8AE8读取配置参数时报错

AP8AE8配置文件即AP8MAX.ASC之类的文件

 

配置参数可以采用绝对路径，如：

如果将AP8MAX.ASC文件放在可执行程序ap8ae8同一目录下，
MNAME变量中也可用相对路径

第214行的变量MNAME和后面1129行代号对应的FORMAT有关，比如A6表示读取MNAME变量中前6个字符，在采用相对路径表示配置文件时，则如下所示：

AP8MAX和.ASC一起组成AP8MAX.ASC配置文件

如果MNAME的变量使用绝对路径，则1129行代号处 FORMAT需要修改。

如

则FORMAT(A49,'ASC')

另外MNAME变量换行时，需要将一行写满