MPI编译环境及编译器介绍

一、基本编译器介绍
集群配置有三套基本的编译器:1、GCC编译器,2、PGI编译器,3、INTEL编译器。介绍如下:

GCCC编译器gcc
C++编译器g++
Fortran 77编译器g77
Fortran 90编译器gfortran
PGIC编译器pgcc
C++编译器pgCC
Fortran 77编译器pgf77
Fortran 90编译器pgf90
INTELC编译器icc
C++编译器icpc
Fortran 77编译器ifort
Fortran 90编译器ifort

二、MPI编译器
MPI编译器实际上是MPI编译MPI程序所使用的编译命令。这些命令在执行过程中仍然调用上个表格中的基本编译命令,只是在多加几个与MPI通信库相关的连接参数而已。所以MPI既可以使用GCC作为编译器又可以使用PGI或者INTEL作为编译器。
MPI在设计之初考虑了在各种通信网络上的工作情况,由于集群既存在Infiniband高速网络,又存在千兆以太网,所以系统为这两种通讯介质都编译对应的MPI版本。
MPI体系:

通信网络使用的基本编译器
OpenMPI体系Infiniband和千兆以太网GCC、PGI、INTEL
MPICH体系Infiniband和千兆以太网GCC、PGI、INTEL
MVAPICH体系Infiniband高速网络GCC、PGI、INTEL

在编译和运行一个MPI程序的时候,只能同时使用一个MPI版本,不能同时混用多个。
用户登录集群后,可以通过命令which mpicc来查看系统目前所使用的mpi版本,或者通过 mpirun –version 来查看。
使用该命令编译后的MPI可执行程序,已cpi.c为例,编译和运行时的命令格式如下:
编译前查看确认路径:

which mpicc

编译和运行前查看当前使用的是哪一个MPI是一个好习惯,也是一个必不可少的步骤,确认MPI路径没有问题后,就可以使用了。
编译:

mpicc -O3 cpi.c -o cpi

生成的可执行程序名字为cpi
运行前查看确认路径:

which mpirun

运行:

mpirun -hostfile ./hostfile -np $(核数) ./cpi

可自行定义用户 .bashrc文件中MPI路径设置

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