人工智能赋能纳米分辨CT表征技术应用于新型纳米药物研发

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📆首发时间:🌹2025年3月5日🌹

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人工智能赋能纳米分辨CT表征技术应用于新型纳米药物研发

人工智能赋能纳米分辨CT表征技术应用于新型纳米药物研发

         同步辐射硬X射线纳米分辨CT成像具有高空间分辨的三维成像能力,可以在亚细胞尺度直接

观察自组装纳米颗粒的三维空间分布行为,对纳米药物研发及探究其药理、毒理学性质具有重要意

义。

 同步辐射硬X射线纳米分辨CT成像

         一种先进的成像技术,重建出物体内部的三维结构图像,用于观察细胞内部的精细结构,如

细胞器的形态和分布;研究生物大分子的组装结构和动态变化;追踪纳米药物在细胞和生物体内的

分布、代谢过程等,为生命科学研究提供了重要的技术支持。

    咱说这个同步辐射硬 X 射线纳米分辨 CT 成像技术吧,本来是挺厉害的,能给细胞里那些自己

组装起来的纳米小颗粒拍 CT 照片。可要是细胞里这些纳米小颗粒数量特别多的时候,这技术就有

点搞不定了,碰到了两个大麻烦。

      第一个麻烦是,细胞里的纳米小颗粒个头特别小,在给它们拍的照片里,很难把这些小颗粒和

细胞里其他东西区分开。而且呢,想把照片里的纳米小颗粒单独挑出来(也就是图像分割)也特别

费劲,因为根本看不清小颗粒的边儿,不知道哪块是小颗粒,哪块是细胞里别的东西。

     第二个麻烦是,因为拍出来的照片数据量特别大,但是又没有一套大家都认可的、标准的处理

这些数据的方法。要是没有标准的处理方法,不同的人处理这些数据的方式就不一样,得出来的结

果也不一样,就没办法准确又有效地分析这些数据了,也很难弄明白这些纳米小颗粒到底在细胞里

是怎么回事儿。

           这项研究里弄出来的 DL-HXT 技术就把这些难题解决了。它可聪明了,能自己自动地找到

细胞本身的结构,像细胞核啥的,还能找到细胞里的纳米小颗粒。而且不管是细胞结构还是纳米小

颗粒,它都能自动地、按照统一标准把它们区分开、认出来,还能做统计分析呢。

        科学家们用 DL-HXT 技术去研究超小氧化铁颗粒(USIO NPs)在缺氧的细胞里,通过酶的作

用自己组装起来的过程。他们发现了 USIO NPs 自己组装后的大小、样子,还有和细胞里其他结

构之间的关系这些特征。还看到了表面被不同东西修饰过的 USIO NPs 在细胞里待的地方和聚集

的情况都不一样。

      另外,DL-HXT 的数据分析技术还提供了一种能一次性处理大量数据的方法,专门用来分析细

胞里纳米小颗粒的三维成像数据,而且是纳米级别的精度,也不需要做标记。分析结果很清楚地告

诉我们细胞里的纳米小颗粒之间是怎么相互影响的,它们在细胞里的位置、怎么聚集的,还有聚在

一起后的样子。

      这个 DL-HXT 技术可帮大忙了,它让我们能在比细胞还小的尺度下,弄明白纳米颗粒是怎么组

装的,还能研究纳米颗粒和细胞里的细胞器之间,以及不同细胞器之间是怎么相互作用的。而且对

以后研究自组装药物的作用原理和开发新的纳米药物来说,它也提供了一个好用的新工具,能用来

评价药物效果啥的。

我们想要实现的功能是:

研究纳米颗粒和细胞器之间的相互作用

         细胞里有很多小零件,像线粒体、内质网这些,我们叫它们细胞器。纳米颗粒是非常非常小

的颗粒,有的时候会被当成药物载体,也就是带着药物进入细胞的 “小快递员”。DL-HXT 技术能让

看清楚这些纳米颗粒进入细胞后,和各个细胞器之间是怎么 “打交道” 的。比如,纳米颗粒会不会

靠近线粒体,是和线粒体相互碰撞了,还是被线粒体吸收了;又或者纳米颗粒和内质网有没有发生

一些反应,影响内质网的功能等等。通过这个技术,我们就能知道纳米颗粒在细胞里的具体行为,

以及它们和细胞器之间的关系,这对理解纳米药物在细胞内的作用过程很有帮助。

研究不同细胞器之间的相互作用

       细胞里的这些细胞器可不是各自独立工作的,它们之间也会相互配合、相互影响。就像一个工

厂里不同的车间,需要一起协作才能让整个工厂正常运转。DL-HXT 技术可以帮助我们观察不同细

胞器之间是怎么互动的。比如,线粒体产生的能量会不会传递给内质网,让内质网更好地工作;高

尔基体和溶酶体之间会不会有一些物质的交换等等。了解这些细胞器之间的相互作用,能让我们更

清楚细胞的工作原理,也有助于发现一些疾病发生的机制。

对自组装药物作用原理研究的帮助

     自组装药物是指那些纳米颗粒可以自己组合在一起,形成特定的结构,然后发挥药物的作用。

DL-HXT 技术能让我们看到这些自组装药物在细胞里是怎么变化的,它们是怎么和细胞里的各种结

构相互作用来产生药效的。比如说,通过这个技术我们可以观察到自组装药物在细胞内的哪个位置

开始发挥作用,是和哪些细胞器相互作用后才产生效果的。这样我们就能更准确地理解自组装药物

的作用原理,为进一步优化药物设计提供依据。

对开发新型纳米药物的帮助及评价药物效果

      在开发新型纳米药物的时候,我们需要知道这个药物好不好用,有没有效果。DL-HXT 技术就

像一个好用的 “检测员”,它可以帮助我们观察纳米药物在细胞内的行为,比如药物的分布情况、聚

集情况,以及药物和细胞内结构的相互作用等。通过这些观察,我们就能判断这个药物是不是能达

到我们预期的效果,是不是安全可靠。如果发现药物在细胞内的行为不理想,我们还可以根据这个

技术提供的信息来改进药物的设计,让它变得更好用。所以说,这个技术为开发新型纳米药物提供

了一个很重要的新工具,能用来评价药物的效果。

我的思考:

样本准备

选择合适的细胞系:根据研究目的,挑选与研究相关的细胞类型,如肿瘤细胞、正常细胞等。这些细胞应该能够代表所研究的生理或病理状态,并且易于培养和操作。

纳米颗粒的制备与标记:合成或获取所需的纳米颗粒,并根据需要对其进行标记。标记可以使用荧光染料、放射性同位素或其他可检测的标签,以便在成像过程中能够清晰地识别纳米颗粒。确保纳米颗粒的尺寸、形状和表面性质符合研究要求,并且具有良好的稳定性和生物相容性。

细胞培养与纳米颗粒处理:将细胞在合适的培养基中培养至对数生长期,然后将制备好的纳米颗粒加入到细胞培养体系中。根据研究需要,确定纳米颗粒的浓度和作用时间,使纳米颗粒能够与细胞充分接触并进入细胞内。在处理过程中,要注意设置对照组,即不添加纳米颗粒的细胞培养组,用于对比分析。

成像与数据采集

DL - HXT 成像参数设置:根据细胞和纳米颗粒的特点,调整 DL - HXT 技术的成像参数,如 X 射线的能量、剂量、扫描速度、分辨率等。确保成像参数能够提供足够的对比度和分辨率,以便清晰地观察纳米颗粒和细胞器的形态和分布。

三维成像:使用 DL - HXT 技术对细胞进行三维成像,获取细胞内纳米颗粒和细胞器的空间分布信息。通过多角度、多层次的扫描,构建出细胞的三维图像,以便更全面地观察纳米颗粒与细胞器之间的相互作用。

时间序列成像:如果需要研究纳米颗粒与细胞器相互作用的动态过程,可以进行时间序列成像。在不同时间点对细胞进行成像,记录纳米颗粒在细胞内的运动轨迹、与细胞器的结合和分离等过程,从而了解相互作用的时间依赖性。

数据采集与存储:将成像过程中获取的大量数据进行采集和存储,以便后续的分析和处理。数据可以以图像文件、数字矩阵等形式保存,确保数据的完整性和准确性。

数据分析与结果解读

图像分割与识别:利用 DL - HXT 技术自带的图像处理软件或其他专业的图像分析软件,对采集到的图像进行分割和识别。将纳米颗粒和细胞器从复杂的细胞图像中分离出来,标记出它们的位置和边界,以便进行定量分析。

定量分析:对纳米颗粒和细胞器的相关参数进行定量分析,如纳米颗粒的数量、大小、分布密度,细胞器的体积、形态、位置等。通过统计分析,比较不同条件下纳米颗粒与细胞器之间的相互作用差异,例如计算纳米颗粒与特定细胞器的共定位系数,以评估它们在空间上的重叠程度。

相互作用分析:观察纳米颗粒与细胞器的空间关系,判断它们是否存在直接接触、包裹、融合等相互作用现象。结合时间序列成像数据,分析纳米颗粒与细胞器相互作用的动态变化过程,如纳米颗粒的摄取、转运、释放等过程与细胞器功能的关系。

结果整合与生物学意义解读:将数据分析得到的结果与生物学知识相结合,探讨纳米颗粒与细胞器相互作用的生物学意义。例如,研究这种相互作用对细胞代谢、信号传导、基因表达等生物学过程的影响,以及与疾病发生、发展的关系,从而得出有价值的研究结论。

(1)改进分割算法,使得分割的效果更好

(2)定量分析:纳米颗粒和细胞器的相关参数进行定量分析,如纳米颗粒的数量、大小、分布密

度,细胞器的体积、形态、位置等。通过统计分析,比较不同条件下纳米颗粒与细胞器之间的相互

作用差异,例如计算纳米颗粒与特定细胞器的共定位系数,以评估它们在空间上的重叠程度。

(3)结合LSTM算法进行相互作用分析:

        观察纳米颗粒与细胞器的空间关系,判断它们是否存在直接接触、包裹、融合等相互作用现

象。结合时间序列成像数据,分析纳米颗粒与细胞器相互作用的动态变化过程,如纳米颗粒的摄

取、转运、释放等过程与细胞器功能的关系。

(4)设计算法评价药物的效果:

       观察纳米药物在细胞内的行为,比如药物的分布情况、聚集情况,以及药物和细胞内结构的相

互作用等。通过这些观察,我们就能判断这个药物是不是能达到我们预期的效果,是不是安全可

靠。如果发现药物在细胞内的行为不理想,我们还可以根据这个技术提供的信息来改进药物的设

计,让它变得更好用。所以说,这个技术为开发新型纳米药物提供了一个很重要的新工具,能用来

评价药物的效果。

(5)药物的效果的可视化展示:

(6)多模态进行结合

与荧光成像结合:荧光成像能对特定的生物分子或结构进行特异性标记,将其与 DL-HXT 技术结合,可以先利用荧光标记来确定细胞器或纳米颗粒的大致位置,再使用 DL-HXT 技术进行更精细的三维结构和相互作用分析。例如,用荧光蛋白标记特定细胞器,通过荧光成像快速定位目标区域,然后用 DL-HXT 技术获取该区域内纳米颗粒与细胞器的详细空间关系和相互作用细节。

与电子显微镜结合:电子显微镜具有极高的分辨率,能提供细胞和纳米颗粒的超微结构信息。与 DL-HXT 技术结合时,DL-HXT 可用于在较大尺度上对细胞内纳米颗粒和细胞器的整体分布和相互作用进行初步观察和分析,确定感兴趣的区域,再利用电子显微镜对这些区域进行高分辨率成像,获取更清晰的纳米颗粒与细胞器的界面结构、分子组装等细节信息。

与核磁共振成像(MRI)结合:MRI 可以提供生物组织的宏观结构和生理信息,将其与 DL-HXT 技术结合,能在整体生物体水平和细胞亚细胞水平之间建立联系。比如在研究纳米药物在体内的分布和作用时,先用 MRI 观察纳米颗粒在整个器官或组织中的分布情况,再通过 DL-HXT 技术深入分析细胞内纳米颗粒与细胞器的相互作用,从而全面了解纳米药物的体内行为。

与拉曼光谱成像结合:拉曼光谱成像可以提供分子水平的化学信息,能识别不同的化学物质和分子结构。与 DL-HXT 技术结合后,可在观察纳米颗粒与细胞器相互作用的同时,通过拉曼光谱分析纳米颗粒和细胞器的化学组成变化,例如检测纳米颗粒在细胞器内是否发生化学反应、细胞器的脂质或蛋白质成分是否因纳米颗粒的作用而改变等。

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