gSpan频繁子图挖掘算法

最新推荐文章于 2025-11-24 11:38:41 发布

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#机器学习 #数据挖掘 #数据 #算法

gSpan算法是图挖掘的重要算法，基于Pattern-Growth策略和最小支持度计数。它首先计算边和点的频度，然后去除不频繁的元素。核心步骤包括DFS编码、subMining过程，用于挖掘频繁子图。算法实现中涉及图编码、最右路径的扩展，并在实际操作中存在一些挑战，如非连续边的处理。尽管有难度，但gSpan适用于化学分子结构等领域的图挖掘。

参考资料：http://www.cs.ucsb.edu/~xyan/papers/gSpan.pdf
http://www.cs.ucsb.edu/~xyan/papers/gSpan-short.pdf
http://www.jos.org.cn/1000-9825/18/2469.pdf

http://blog.csdn.net/coolypf/article/details/8263176

更多挖掘算法：https://github.com/linyiqun/DataMiningAlgorithm

介绍

gSpan算法是图挖掘邻域的一个算法，而作为子图挖掘算法，又是其他图挖掘算法的基础，所以gSpan算法在图挖掘算法中还是非常重要的。gSpan算法在挖掘频繁子图的时候，用了和FP-grown中相似的原理，就是Pattern-Grown模式增长的方式，也用到了最小支持度计数作为一个过滤条件。图算法在程序上比其他的算法更加的抽象，在实现时更加需要空间想象能力。gSpan算法的核心就是给定n个图，然后从中挖掘出频繁出现的子图部分。

算法原理

说实话，gSpan算法在我最近学习的算法之中属于非常难的那种，因为要想实现他，必须要明白他的原理，而这就要花很多时间去明白算法的一些定义，比如dfs编码，最右路径这样的概念。所以，我们应该先知道算法整体的一个结构。

1、遍历所有的图，计算出所有的边和点的频度。

2、将频度与最小支持度数做比较，移除不频繁的边和点。

3、重新将剩下的点和边按照频度进行排序，将他们的排名号给边和点进行重新标号。

4、再次计算每条边的频度，计算完后，然后初始化每条边，并且进行此边的subMining()挖掘过程。

subMining的过程

1、根据graphCode重新恢复当前的子图

2、判断当前的编码是否为最小dfs编码，如果是加入到结果集中，继续在此基础上尝试添加可能的边，进行继续挖掘

3、如果不是最小编码，则此子图的挖掘过程结束。

DFS编码

gSpan算法对图的边进行编码，采用E(v0,v1,A,B,a)的方式，v0,v1代表的标识，你可以看做就是点的id,A,B可以作为点的标号，a为之间的边的标号，而一个图就是由这样的边构成的，G{e1, e2, e3,.....}，而dfs编码的方式就是比里面的五元组的元素，我这里采用的规则是，从左往右依次比较大小，如果