数学建模教程：GSpan-频繁子图挖掘算法

0 前言

本人计算机研在读，专业带队数学建模，长期更新建模教学，有需要的同学欢迎讨论～
本篇文章，本系列学长讲解一部分数学建模常用算法，会陆续更新每个算法的详细实现和使用教程

1 算法介绍

频繁子图挖掘是数据挖掘中一个非常广泛的应用。频繁子图挖掘是指从大量的图中挖掘出满足给定支持度的频繁子图，同时算法需要保证这些频繁图不能重复。频繁模式挖掘主要就是应用两种策略（这里不讨论基于垂直增长的方法）——Apriori和Growth。最早的AGM和FSG就分别实现了这两重策略的基本思想。gSpan是一个非常高效的算法，它利用dfs-code序列对搜索树进行编码，并且制定一系列比较规则，从而保证最后只得到序列“最小”的频繁图集合。

2 算法实现过程

1、遍历所有的图，计算出所有的边和点的频度。

2、将频度与最小支持度数做比较，移除不频繁的边和点。

3、重新将剩下的点和边按照频度进行排序，将他们的排名号给边和点进行重新标号。

4、再次计算每条边的频度，计算完后，然后初始化每条边，并且进行此边的subMining()挖掘过程。

2.1 subMining的过程

1、根据graphCode重新恢复当前的子图

2、判断当前的编码是否为最小dfs编码，如果是加入到结果集中，继续在此基础上尝试添加可能的边，进行继续挖掘

3、如果不是最小编码，则此子图的挖掘过程结束。

2.2 DFS编码

gSpan算法对图的边进行编码，采用E(v0,v1,A,B,a)的方式，v0,v1代表的标识，你可以看做就是点的id,A,B可以作为点的标号，a为之间的边的标号，而一个图就是由这样的边构成的，G{e1, e2, e3,…}，而dfs编码的方式就是比里面的五元组的元素，我这里采用的规则是，从左往右依次比较大小，如果谁先小于另一方，谁就算小，图的比较算法同样如此，具体的规则可以见我后面代码中的注释。但是这个规则并不是完全一致的，至少在我看的相关论文中有不一样的描述存在。

2.3 生成subGraph

生成子图的进行下一次挖掘的过程也是gSpan算法中的一个难点，首先你要对原图进行编码，找到与挖掘子图一致的编码，找到之后，在图的最右路径上寻找可以扩展的边，在最右路径上扩展的情况分为2种，1种为在最右节点上进行扩展，1种为在最右路径的点上进行扩展。2种情况都需要做一定的判断。

2.4 算法的技巧

算法在实现时，用的技巧比较多，有些也很不好理解，比如在dfs编码或找子边的过程中，用到了图id对于Edge中的五元组id的映射，这个会一开始没想到，还有怎么去描述一个图通过一定的数据结构。

python实现

实现放在了github上
https://github.com/betterenvi/gSpan

最后

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