虚拟机ubuntu14.04编译MPI版本NAMD

最近，尝试用ubuntu编译NAMD，由于以前对NAMD完全未接触过，也不懂该专业的相关知识，因此作为一个外行人尝试编译NAMD，这里记录一下粗略过程：

1.首先，需要搭建MPI并行环境：http://blog.csdn.net/xiaoqiangqiangjie/article/details/53079181。

2.从官网下载source code，http://www.ks.uiuc.edu/Development/Download/download.cgi?PackageName=NAMD，建议下载稳定版本的source code，而不是Nightly Build版本（日日更新版本）。

3.根据官方的教程，选择mpi版本的编译教程手册，http://www.ks.uiuc.edu/Research/namd/2.12b1/notes.html#compiling，从Compiling NAMD处开始跟着做，注意选择MPI版本的编译教程。

4.编译好之后，运行程序便