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RSS订阅原创 计算机辅助高通量虚拟筛选的技术笔记巩固知识要点
高通量虚拟筛选技术是一种基于高通量实验技术开展的高效筛选方法，能够极大提高样品处理和分析的速度和精度，成为众多领域的重要工具。由于传统实验室药物发现成本高、效率低，迫切需要一种虚拟药物筛选模型，对海量化合物进行高通量筛选。
2023-08-30 13:36:34
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原创 第一性原理计算方法及应用（VASP学习大纲）
VASP是目前材料微观反应机理和计算材料电子结构性质科学研究中最流行的一款软件，它可以处理金属及其氧化物、半导体、晶体、掺杂体系、纳米材料、分子、团簇、表面体系和界面体系等。
2023-08-22 11:36:18
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转载 当药物设计遇上MD，分子结构藏不住了！
分子动力学模拟(MDS)是近年来飞速发展的一种分子模拟方法，它以经典力学、量子力学、统计力学为基础，利用计算机数值求解分子体系运动方程的方法，模拟研究分子体系的结构与性质。分子动力学模拟的基本原理即为牛顿运动定律。
2023-07-03 15:42:11
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原创 四天后你就是应用分子动力学软件（NAMD、AMBER）的神！
分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法，能够从原子层面给出体系的微观演变过程，直观的展示实验现象发生的机理与规律，促使学术研究向着更高效、更经济、更有预见性的方向发展。可以解决和研究DNA的折叠和性质、蛋白与配体的识别机制、跨膜蛋白的工作机理、蛋白酶与底物的反应、蛋白与蛋白的耦合、比较野生型与突变蛋白的不同特性等。
2023-06-28 17:36:12
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原创 仅用四天掌握”COMSOL 多场耦合仿真技术与应用”光电专题
基础入门阶段采用Step by step的教学方式带着做具体的案例，在案例中学习COMSOL应用必备技能，帮助学员快速掌握COMSOL的仿真框架，建立正确的仿真思路。通过模块详解掌握各种边界条件和域条件的设置方法和技巧，区分每个边界条件或域条件应该在什么场景中应用。掌握精确仿真电磁场所需的网格划分标准及优化技巧，深入探索从模拟中获得的结果（如分析设计方案中的电磁场分布、功率损耗、传输和反射、阻抗和品质因子等），对光子器件、集成光路、光波导、耦合器、光纤等设计进行优化。
2023-06-12 14:44:39
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原创 Gaussian量子化学计算技术与应用专题指南
本次计算课程专门为化学、材料科学领域量身打造，采用全方位的课程体系设计，在线直播教学，课后提供无限次回放视频，发送全部案例资料，建立永不解散的课程群，在班级群内可以和相同领域内的老师同学互动交流问题，让学习不再是一个人的孤独求索。
2023-05-30 10:39:50
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原创 入门实操Gaussian量子化学、LAMMPS分子动力学模拟
次计算课程专门为化学、材料科学领域量身打造，共分为两个个专题，采用全方位的课程体系设计，在线直播教学，课后提供无限次回放视频，发送全部案例资料，建立永不解散的课程群，在班级群内可以和相同领域内的老师同学互动交流问题，让学习不再是一个人的孤独求索。
2023-05-25 16:00:56
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原创 在COMSOL燃料电池里面挖呀挖呀挖
主要讲解燃料电池仿真应用，以燃料电池仿真、多孔电极模型、尘气输运模型、纽扣电池模型、连接体模型、直接碳燃料电池模型（ 传质-导电-电化学-热多场耦合 ）以及应力分析为例，带大家掌握 COMSOL 仿真从简到真的燃料电池建模方法。
2023-05-06 14:26:21
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原创 COMSOL锂离子电池基础教学-精编
本文章面向各省市、自治区从事电化学、电气工程、材料科学、无机化工、化学工程、自动化技术、能源动力及新能源等事业单位技术骨干、科研院所、高校相关专业的在校硕士、博士研究生以及广大爱好者。
2023-05-04 17:31:54
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转载 零基础两天快速学习Rosetta蛋白抗体设计
Rosetta 是一种生物物理建模工具， 根据蛋白质的氨基酸序列有效预测蛋白质的结构，在此基础上可以从头设计各种类型的全新蛋白质。 基于 Rosetta 系列算法的蛋白设计在过去十年中在创新蛋白药物、抗体、疫苗、新型合成生物学元件及纳米药物等生物大分子研究领域中被广泛使用。
2023-04-27 15:59:23
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原创 极限四十八小时，我用“Rosetta”开了外挂~
本专题采用北京线下授课的形式，面对面教学，与老师及时进行沟通。所有专题均建立永不解散的课程群，长期互动答疑，学员学完后可以继续与专业老师同学交流问题，巩固学习内容，从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求。
2023-04-24 15:47:53
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原创 （初学者必看内容）帮你打开通向CADD的大门
对于初学者来说，CADD应该如何入手？如何快速掌握方向，应该要学习哪些内容？对于自学了一段时间的同学来说，帮助判断你的学习方向有没有出错，看完这篇文章能够打开你的思路。
2023-04-21 10:51:17
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转载 Concerto | 利用自蒸馏来建模单细胞图谱
今天为大家分享一篇2022年发表在Nature Machine Intelligence 上的文章，题目为“Contrastivelearningenablesrapidmappingtomultimodalsingle-cellatlasofmultimillionscale”，文章提出了Concerto方法，这是一种基于深度学习的方法，利用自蒸馏来建模单细胞图谱，并且可以应用于多种下游任务。
2023-04-18 10:18:06
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转载 创新药物研究核心技术—计算机辅助药物设计
本文章对药物研究模式的转变、药物设计思想的起源、计算机辅助药物设计概述以及计算机辅助药物设计的发展过程等方面展开介绍。
2023-04-13 14:52:56
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原创 安利零基础学习多组学（机器学习）
通过基础入门+进阶实例演练的讲授思路，从初学及应用研究角度出发，带大家实战演练机器学习在多组学整合分析中的数据处理、预测模型以及生物学意义阐述等，助力大家掌握多种机器学习算法模型的构建以及在多组学联合分析在肿瘤及慢性病中的实际应用。
2023-04-11 14:16:25
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原创 Rosetta从头蛋白抗体设计、结构优化及在药物研发中的应用
因此，优化蛋白质的稳定性是科学研究与工程应用领域亟待解决的关键问题。Rosetta是一种生物物理建模工具，根据蛋白质的氨基酸序列有效预测蛋白质的结构，在此基础上可以从头设计各种类型的全新蛋白质。教学目标：了解Rosetta封装好的应用（以relax为例）和RosettaScript编写应用（以pack/min/pack为例）。教学目标：熟悉RosettaScript开发流程，了解序列与结构设计原理，完成从头蛋白质设计的操作练习。教学目标：了解基于序列和基于结构的蛋白质复合物预测手段。
2023-03-29 10:51:13
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转载 COMSOL Multiphysics电化学-热耦合（超细节）
本文主要介绍如何利用COMSOL Multiphysics电化学-热耦合模型对电动汽车动力电池的内部温度进行数值模拟
2023-03-20 14:31:21
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原创 ”COMSOL“竟然如此简单！我悟了！！
COMSOL Multiphysics具有强大的多物理场全耦合仿真分析功能、高效的计算性能，可以保证数值仿真的高度精确，已被广泛应用于各个学科领域，近年来运用COMSOL来解决电化学实际工程问题也越来越普遍。
2023-03-07 18:03:04
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空空如也
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