LAMMPS 模拟液滴在疏水表面的撞击（使用 MATLAB）

LAMMPS 模拟液滴在疏水表面的撞击（使用 MATLAB）

在本文中，我们将介绍如何使用 LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）和 MATLAB 结合起来模拟液滴在疏水表面的撞击现象。LAMMPS 是一个经典分子动力学软件包，可以用来模拟原子和分子系统的行为。我们将使用 MATLAB 脚本来设置模拟参数、处理结果数据并进行可视化。

首先，我们需要准备模拟所需的输入文件。在 LAMMPS 中，输入文件通常使用文本文件格式，包含了模拟系统的初始状态、参数设置和运行命令。下面是一个示例的输入文件：

# 输入文件示例
units           real
dimension       3
boundary        p p p
atom_style      full

# 创建原子的类型
lattice         fcc 0.8442
region          box block 0 20 0 20 0 20
create_box      1 box
create_atoms    1 box

# 定义原子的性质
mass            1 16.00
pair_style      lj/cut 2.5
pair_coeff      1 1 0.238 3.405

# 定义力场和时间步长
velocity        all create 1.0 87287
fix             1 all nve

# 定义疏水表面
regio