凋亡+自噬+焦亡，预后模型+实验验证的干湿结合模式-CSDN博客

本文链接：https://blog.csdn.net/2301_79430545/article/details/132741420

今天给同学们分享一篇多热点机制+预后+实验的生信文章“Identification and validation of a prognostic signature of autophagy, apoptosis and pyroptosis-related genes for head and neck squamous cell carcinoma: to imply therapeutic choices of HPV negative patients”，这篇文章于2023年1月10日发表在Front Immunol期刊上，影响因子为8.786。

人乳头瘤病毒（HPV）阳性的HNSCC患者通常具有良好的生存率，并对放疗、化疗放疗和检查点阻断有良好的反应。然而，HPV阴性患者，也就是大多数HNSCC患者，一直被忽视。细胞死亡已经与癌症治疗抵抗有关。为此，作者旨在确定自噬、凋亡和焦亡相关基因与HNSCC预后的关联，并构建一个预后标志来预测HNSCC的预后，特别是HPV阴性的HNSCC。

1. 与头颈部鳞状细胞癌患者的总体生存相关的自噬、凋亡和焦亡相关基因

作者在TCGA数据集中使用单变量Cox回归分析筛选了48个与整体生存相关的自噬、凋亡和焦亡相关基因。与上述基因的临床病理特征相关的特征显示在图1A中。使用LASSO回归模型选择了27个基因，使用逐步多元Cox回归模型选择了16个基因。这16个与整体生存相关的基因包括五个与凋亡相关的基因（BCAP31、CDKN2A、FNTA、STK24和YWHAQ）、十个与自噬相关的基因（ATG5、CSNK2A2、DYNC1I1、MVB12A、MVB12B、RRAGA、TSG101、PRKN、VDAC1和VPS37C）以及一个与焦亡相关的基因（NLRP1）（图1B）。随后作者分析了这些与整体生存相关的基因之间的相关性（图1C）。STK24与YWHAQ呈正相关，与MVB12A呈负相关，而DYNC1I1与PRKN呈正相关，相关系数绝对值超过0.4。