4+机器学习+实验验证

今天给同学们分享一篇4+机器学习+实验验证的生信文章“Identification and Analysis of Neutrophil Extracellular Trap-Related Genes in Osteoarthritis by Bioinformatics and Experimental Verification”，这篇文章于2023年8月31日发表在 J Inflamm Res 期刊上，影响因子为4.5。

骨关节炎（OA）是一种常见的关节疾病，长期疼痛和功能障碍会对患者的生活质量产生负面影响。中性粒细胞胞外捕获物（NETs）由 DNA、蛋白质和细胞质组成，由中性粒细胞释放，在多种疾病中发挥重要作用。然而，OA 与 NET 之间的关系尚不清楚。

1. 识别 OA 患者的 DE-NRGs

将 GEO 数据库中收集到的四个 OA 相关数据进行合并，并校正批次效应，以减少后续分析中的误差。以P-adjust<0.05 and |logFC|>0.585作为Con组和OA组差异分析的筛选标准，最终得到133个下调差异表达基因和120个上调差异表达基因（DEGs）（图1A）。如热图所示，表达显著上调或下调的前 50 个基因被突出显示（图 1B）。通过将 255 个 DEGs 与 69 个 NRGs 相交，确定了 7 个与 OA 过程有关的 DE-NRGs（TLR7、CRISPLD2、SLC25A37、IL1B、IL6、MM