使用 python 处理 nc 数据_用python处理(2)

可以使用 gdal 查看数据信息,执行:

gdalinfo name.nc

即可得到如下信息:

每一个 SUBDATASET 表示记录的是一种格式的数据(气象、水文等等),如果要想查看此 SUBDATASET 的具体信息,可以执行:

gdalinfo NETCDF:name.nc:SUBDATASET_NAME

此处的 SUBDATASET_NAME 为上面的 T2、PSFC 等等,可以得到如下信息:

此处只有一个 Band ,每一个 Band 记录了一个时间点(或者其他区分形式)的一条记录,这个记录是一个数组。

所以看到这里,各位应该已经明白了,可以直接使用 GDAL 处理 nc 数据,比如直接使用 gdalwarp 将某个 SUBDATASET 转成 GeoTiff 等等,此处暂且不表,各位只需要查阅一下 gdalwarp 手册即可知道如何处理。

明白了以上信息基本也就清楚了如何处理此数据。

二、数据处理

python 是运用非常广泛,自然其下各种类库非常丰富,专业一点的说法就叫生态丰富。

2.1 netCDF4

此框架可以直接将 nc 读取成数组(详细信息参考https://github.com/Unidata/netcdf4-python)。读取方式如下:

dataset = netCDF4.Dataset(‘name.nc’)# open the dataset

这样即可读出整个 nc 中的数据信息,如果需要获取某个 SUBDATASET 只需要使用 dataset[SUBDATASET_NAME] 即可,返回的是一个三维数组,表示不同时间段(或其他区分方式下)的数据信息。

我们可以对此数组做各种操作,如求平均值、方差等等,又让我想起了大学里的那一堆枯燥但又让人很有兴趣的实验课程。当然,此处如果使用 numpy 框架进行处理,会起到事半功倍的效果,如求长时间序列下的平均值:

到这里跟地信有关的同志都会看出一个问题,此框架只能对数据进行处理,而不能进行与位置有关的操作,这就导致数据无法变成直白的地图可视化效果。其实任何数据都是相通的,我们可以采用此种方式处理完后转为 GeoTiff 等,当然我们也可以直接采用 GeoTiff 的处理流程来进行处理。

2.2 rasterio

rasterio 是 Mapbox 开源的空间数据处理框架,功能非常强大,此处不细说,只表如何处理我们的 nc 数据。

当然第一种方式就是使用 netCDF4 处理完之后,使用此框架写入 GeoTiff,但是这样不太优雅,而且使用了两个框架,明显过于麻烦,我们直接使用此框架从读数据开始处理。

此处读的时候就有技巧了,要像采用 gdalinfo 读取 SUBDATASET 一样来直接读取此 SUBDATASET 数据,如下:

即给 open 函数传入 NETCDF:name.nc:SUBDATASET_NAME,采用 src.read(range(1, dim + 1)) 可以直接读出此范围内所有 Band (时间点)的信息,范围可以自己设定,注意从 0 开始,当然也可以仅读取某个 Band 的信息。

src.meta 记录了此 SUBDATASET 的元数据信息,与 gdalinfo 看到的基本相同。

这样我们就可以继续将此数据使用 numpy 等框架进行处理,处理完之后更重要的是要写入 GeoTiff 中(直白的说就是添加空间信息)。

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