AbMole|解读横纹肌肉瘤研究新突破:探索细胞奥秘,照亮治疗之路


在医学科研的浩渺星空中,每一项新的发现都如同璀璨的星辰,为人类战胜疾病带来新的希望。今天,我们将深入探讨一篇发表于《Nature Communications》的重要研究论文。

来自Princess Máxima 儿科肿瘤学中心的Jeff DeMartino, Michael T Meister , Lindy L Visser等多名研究人员发表了题为《Single-cell transcriptomics reveals immune suppression and cell states predictive of patient outcomes in rhabdomyosarcoma》的研究成果。

在该文章中,研究人员使用了购自AbMole的Y-27632(目录号M1817)

这项研究通过单细胞 mRNA 测序构建了横纹肌肉瘤(RMS)的转录组图谱,为我们揭示了这种复杂疾病背后的奥秘。RMS 是儿童和青少年中最常见的软组织肉瘤,预后较差,其肿瘤细胞异质性和肿瘤微环境(TME)的组成及相互作用一直是科学界亟待解开的谜题。

研究团队对 27 例 RMS 样本进行了单细胞 mRNA 测序,其中包括 19 例原发性样本和 8 例肿瘤类器官模型。这一壮举如同绘制了一幅微观世界的地图,让我们得以一窥 RMS 的细胞组成。通过 SingleR 和 InferCNV 两种方法,他们成功地区分了 RMS 细胞和 TME 中的非恶性细胞类型,并在 UMAP 空间中清晰地展示了细胞的聚类情况。这一图谱的构建为后续的深入分析奠定了坚实的基础。

图 1:RMS 肿瘤的单细胞转录组图谱。

对原发性 RMS 样本中的髓样细胞和 T/NK 细胞进行基于图的聚类分析,揭示了一个令人深思的现象:M2 极化状态的巨噬细胞在 RMS 的微环境中占主导地位。这种极化状态的巨噬细胞通常与免疫抑制相关,可能为肿瘤的生长和扩散提供了有利的环境。此外,研究还发现 FP 亚型中 NECTIN3 和 TIGIT 之间存在相互作用,这种相互作用可能导致肿瘤诱导的 T 细胞功能障碍。这一发现为我们理解 RMS 的免疫逃逸机制提供了重要线索。    

图 2:RMS 免疫微环境的特征。

通过逻辑回归模型,研究人员将原发性 RMS 肿瘤细胞与正常肌生成分化背景下的细胞进行了比较。他们发现 FN RMS 细胞类似于肌源性祖细胞和肌源性间充质细胞,而 FP 细胞最接近成肌细胞。这一发现表明不同亚型的 RMS 肿瘤细胞具有不同的起源和分化状态。    

为了进一步深入研究恶性细胞的转录程序,研究团队应用了非负矩阵分解(NMF)方法。在 FN RMS 中,他们发现了类似于早期肌生成的分化轨迹;而在 FP RMS 中,细胞状态类似于骨骼肌再生的分化轨迹。这些发现不仅加深了我们对 RMS 肿瘤细胞生物学特性的理解,也为开发针对性的治疗策略提供了新的思路。

图 3:NMF 定义了 FN RMS 肿瘤中的恶性细胞状态。

为了验证研究结果的可靠性,研究人员对 RMS 肿瘤类器官模型中的细胞进行了 NMF 分析。令人振奋的是,他们发现类器官模型中的细胞反映了原发性肿瘤中的亚型特异性细胞状态。这一结果表明,RMS 的异质性主要源于恶性细胞本身,而非 TME 诱导。这为我们进一步研究 RMS 的发病机制提供了重要的实验依据。

研究的最后一个重要环节是分析恶性细胞状态与患者预后的关系。通过对已发表的 RMS 肿瘤基因表达谱数据集进行分析,研究人员发现了一些关键的关联。在 FN RMS 患者中,肿瘤分化评分高(间充质样 + 成肌样)的患者总体生存率显著高于评分低的患者,而未分化祖细胞样程序评分高的患者总体生存率显著低于评分低的患者。在 FP RMS 患者中,SC 样程序表达高的患者总体生存率较高,而增殖程序评分高的患者总体生存率较低。

这一发现为 RMS 的临床治疗提供了重要的指导意义。通过评估患者肿瘤的分化状态和细胞程序表达情况,医生可以更好地预测患者的预后,并制定个性化的治疗方案。

综上所述,这项研究通过单细胞 mRNA 测序构建了横纹肌肉瘤的转录组图谱,深入表征了 RMS 的微环境和恶性细胞状态,并分析了其与患者预后的关系。这些发现为我们理解 RMS 的发病机制提供了新的视角,也为开发更有效的治疗策略带来了新的希望。相信在不久的将来,这些研究成果将为 RMS 患者带来更好的治疗效果,让他们重获健康和希望。  

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