【教程】如何提取茄子表型特征?

中国是茄子的第二起源及次生演化中心,拥有丰富的茄子种质资源。茄子种质创新、遗传改良和品种选育需要丰富的种质资源,而开发利用种质资源的前提是对其进行评价鉴定。农艺性状的鉴定和描述是种质资源研究最直接、最基本的方法和途径,通过对此类性状进行遗传多样性分析,可以从整体上把握资源的丰富程度,为育种者下一步进行种质筛选、亲本选配、品种分类和资源保护等提供重要依据。

工具/

① 一块背景布(黑色或蓝色)和一个白板(5cm*5cm)、成像设备(数码相机、手机、无人机、扫描仪、单反相机等均可)、需要分析的样本

②PhenoAI分析系统

 方法/步骤

步骤一:将样本和白板放置背景布上,并用手机进行拍照

 步骤二:点击【选择图片】【选择文件夹】提取需要分析的图片,点击【运行】即可

*分析结果自动弹出(各作物的轮廓标记图及数据汇总表) 

结论

该系统适用于各类茄果作物,自动化提取近60个表型指标,包括形态(果横径、果纵径、面积、周长、圆度等)、颜色(R、G、B、H、S、V、L、a、b 等)、纹理(dissimilarity、energy、correlation、ASM、entropy 等)三大类指标,并且还能通过添加模型功能扩展任意个性化功能,针对个性化或细粒度提取需求,分析平台支持添加任意机器学习或深度学习模型进行个性化拓展。

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