freesurfer海马分为前、中、后海马

freesurfer

freesurfer自动分割海马

使用上一篇文章中提到的freesurfer自动分割流程分割海马，对于freesurfer7 使用segmentHA_T1.sh指令进行海马亚区的分割，对于T2图像也有对应指令，但是也有像我这种版本较低的情况，我使用的是freesurfer6，因此我使用的是freesurfer提供的一个较老的方法，利用的是recon-all的指令提供的一个选项，具体实现方法请参考上一篇文章。

https://blog.csdn.net/AliceMeng20/article/details/141395809?spm=1001.2014.3001.5502

freesurfer的安装以及之前的处理流程这里不再详细解释，如果需要了解，请参考之前的文章或者freesurfer官网。
https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FreeSurferWiki

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