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本文介绍了使用Freesurfer6进行海马分割的步骤，包括Matlab Runtime的安装，运行`recon-all`命令进行海马分割，以及通过`quantifyHippocampalSubfields.sh`收集海马体积。详细步骤涉及在特定目录下检查分割结果和执行脚本。
利用freesurfer6进行海马分割的环境配置和步骤
Matlab Runtime 安装
一些 freesurfer 模块，例如 fsfast 和子场/核分割工具，需要 matlab 运行时包 (MCR)。 MCR 允许用户运行分布式 matlab 编译的程序，而无需支付 matlab 许可证费用。 freesurfer 命令 fs_install_mcr 可用于安装此软件包。 MCR版本要求如下。
在 freesurfer 7.0 以上版本时，请通过运行以下命令安装 MCR 8.4 (R2014b)：
fs_install_mcr R2014b
在 freesurfer 6.0 版本时，请通过运行以下命令安装 MCR 8.0 (R2012b)：
fs_install_mcr R2012b
注意：如果 fs_install_mcr 脚本在您的 freesurfer 发行版中不可用，可以通过运行以下命令来下载：
cd $FREESURFER_HOME/bin && 
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