freesurfer
FreeSurfer是一套开源的软件工具,用于分析和可视化人脑MRI数据。它在神经科学和临床研究中广泛应用,主要用于对脑结构进行自动化分割、皮层厚度测量、表面重建、功能与解剖图像的配准等任务。
FreeSurfer广泛应用于神经科学、精神病学、神经病学等领域的研究中,例如:
- 研究脑部疾病(如阿尔茨海默病、抑郁症、精神分裂症)对脑结构的影响。
- 研究正常脑发育过程中皮层厚度和体积的变化。
- 结合功能MRI数据研究脑功能网络。
官网:https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/
FreeSurfer提供了详细的用户手册和教程,帮助用户理解软件的使用方法和原理。
在FreeSurfer中,mri_vol2label、mri_vol2roi、mri_vol2vol 是用于处理MRI图像和标签数据的重要指令。
mri_vol2label
该指令用于将体积(volume)图像中的特定区域转化为FreeSurfer标签(label)文件。标签文件表示在脑表面上的特