CRISPR抑制(CRISPRi)技术使用丧失酶切活性的Cas9(deadCas9,dCas9),dCas9能到达向导RNA指定的位点,但无力对DNA进行剪切(Cell, 152:1173-83, 2013)。当dCas9结合到基因组的时候,会阻断转录机器的结合,能抑制靶基因的转录,而不论靶基因是编码还是非编码的DNA片段。CRISPRi的可逆性是其一大特色。另一项成熟的基因抑制实验:RNA干扰(RNAi)技术的作用靶点是RNA,而CRISPRi阻止转录的起始,对基因的沉默更彻底。此外RNAi的脱靶效应一直令人担忧。虽然CRISPR系统也存在脱靶效应,但要比RNAi少得多,因为CRISPRi必须在转录起始位点附近才能发挥作用。以下的dCas9稳转细胞系可用于CRISPRi实验,仅需转染向导RNA即可实现CRISPRi。
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经典的CRISPR/Cas9基因编辑系统,通过突变Cas9核酸内切酶的HNH结构域和RuvC结构域,在保留Cas9蛋白结合dna靶序列的基础上,消除DNA剪切能力,构建了dCas蛋白(deadCas9,dCas9)。当dCas蛋白结合DNA后,抑制转录激活因子结合靶序列,形成基因暂时沉默,当dCas9蛋白被细胞自然清除后,转录又可以恢复。
相比另一种基因表达调控工具RNA干扰(RNAi),CRISPRi基因沉默作用可逆,并且从转录起始抑制,基因沉默更彻底,由于必须在转录起始位点附近才能发挥作用,CRISPRi脱靶效应更低。
北京泽平代理的dCas9蛋白稳转细胞系(dCas9稳转细胞株),将dCas9蛋白基因转染入各类常用细胞系,通过筛选单克隆,可以得到稳定表达dCas9蛋白的细胞系。实验时,仅需转染gRNA/sgRNA,进而高效实现基因沉默,令CRISPRi操作大大简化,而无需面对核糖核蛋白复合体RNP大分子转染效率低的问题。