易基因科技-CSDN博客

原创易基因项目文章｜WGBS+RNA-seq揭示PM2.5引起男性生殖障碍的DNA甲基化调控机制

该研究通过对小鼠睾丸组织的全基因组重亚硫酸盐测序（Whole gene bisulfite sequencing,WGBS）与对应的转录组测序（RNA-seq）联合分析，鉴定出与类固醇生成和精子发生过程相关的关键基因和通路，揭示了PM2.5导致男性生殖障碍的潜在DNA甲基化调控机制。（D-H）每个VII期曲细精管的Sertoli细胞（D）、精原细胞（E）、粗线期精母细胞（F）、圆形精子细胞（G）和总生殖细胞（H）的计数（n=15）。（J） DMR相关基因（DMG）生物过程的富集分析。

2022-10-09 09:49:15 1448

原创 ChIP-seq应用领域、研究思路、数据挖掘、下游实验、实验关键 | 易讲堂

在ChIP的基础上，用二代测序检测ChIP实验的DNA产物，将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-seq技术，可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定，为研究的深入开展打下基础。ChIP-seq技术能够提供更高的分辨率、更少的噪音和更大的覆盖范围，然而其只能在明确感兴趣的蛋白（或转录因子）后，才能针对性富集相应的DNA，因此，ChIP-seq需要与其他技术和方法相配合才能更好的进行表观基因组的研究。另外，针对同一蛋白的不同抗体，可能会识别不同的表位（尤其是单克隆抗体）。..

2022-08-17 10:32:15 2370

原创易基因｜染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)分析实验全流程

染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和实验成功的关键问题等四方面详细介绍。手把手教你做染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)分析实验。

2022-07-14 11:27:51 5219

原创易基因｜干货：m6A RNA甲基化MeRIP-seq测序分析实验全流程解析

本期，我们讲讲甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和研究套路等四方面详细介绍。

2022-06-24 10:44:44 5900 1

原创易基因｜新品：新型肿瘤标志物检测利器——cfDNA甲基化测序（cfDNA-RBS）

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。游离DNA（Circulating free DNA，cfDNA），是人体组织释放到血液等循环体系中的降解的DNA片段，是一种新型的肿瘤分子标志物。ctDNA（Circulating tumor DNA）特指来源于肿瘤细胞的cfDNA，ctDNA甲基化是重要的表观学修饰之一，可以在不改变基因序列的情况下，改变遗传表现，从而控制基因的表达。基因甲基化发生是癌症发生的重要机制，相当于调控基因表达的“开关”，其稳定性和一致性较好，因此ctDNA甲基

2022-04-01 13:44:42 4151

原创易基因｜全基因组cfDNA甲基化分析提高了早期乳腺癌无创诊断成像的准确性

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。乳腺癌早期发现是提高患者预后和生存率的关键。基于乳房X线片和超声技术的乳腺影像报告和数据系统(BI-RADS)被广泛用于乳腺癌的早期诊断，但这种方法的假阳性率较高，会导致不必要的活检，尤其是对于BI-RADS-4类的患者来说。而携带DNA甲基化信息的游离DNA(cfDNA)已经成为一种非侵入性的癌症检测方法。在本文中，作者进行了一项前瞻性多中心研究，利用全基因组重亚硫酸盐测序数据来研究203名疑似恶性乳腺病变的女性患者cfDNA甲基化标志物的

2022-03-31 13:41:47 3606

原创项目集锦 | 易基因DNA羟甲基化5hmC测序研究成果

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。羟甲基化5hmC是哺乳动物基因组上的第六碱基，在发育、衰老、神经退行性疾病、复杂疾病及肿瘤发生过程中起重要作用。本期以科研内容为序，总结近期易基因羟甲基化合作研究成果。01 宫颈癌 WGBS + oxWGBS标题：An epigenomic landscape of cervical intraepithelial neoplasia and cervical cancer using single-base re

2022-03-24 11:34:43 1423

原创易基因｜一文看懂：ChIP实验和qPCR定量分析怎么做

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。想要获得理想的ChIP结果，选择适合的抗体固然很关键，ChIP 流程中所有步骤也很重要。本文对ChIP实验之前的准备、获得理想ChIP结果步骤、ChIP的qPCR定量分析和ChIP案例分析进行总结，希望帮助到正在做ChIP实验和qPCR定量分析的您。开始 ChIP 之前要考虑三件事（1）为您

2022-03-23 11:59:50 5109

原创宏病毒组富集技术详解

宏病毒组富集技术详解病毒可以说是地球上最大的生物实体之一，但是由于他们具有形态小，遗传物质进化快等的特点，因而不能像细菌、古菌等微生物一样有系统的发育标记，这为其鉴别增加了一定的难度。此外，对于病毒与宿主之间相互关系的研究，也被限制在了可培养的病毒-宿主系统中，这使得对其研究十分困难。目前对病毒组的了解主要是通过以下几个技术的结合，其中包含了传统的病毒培养技术、高分辨率显微镜技术，PCR技术及高通量宏基因组测序分析技术（表1）。目前，通过采用与肠道细菌组的研究相类似的方法，对肠道病毒组中相关复杂病毒群落

2020-08-18 12:00:24 3055

原创病毒宏基因组学（Meta-virome）

宏基因组学（Meta-virome）是在宏基因组学理论的基础上，结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支，是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle)及其所携带遗传信息的总称。宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象，能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成，在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用。宏病毒研究可应用于人或动物肠道或者血液样本、海洋、土壤等的研究，用以挖掘潜在的对人类和环境的危害。易基因科技同丹麦哥本哈根大学

2020-08-06 11:11:44 3799

原创单细胞转录组：Smart-seq 2还是10X Genomics Chromium?

应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍，当下应用最火热的是10X Genomics公司的Chromium解决方案（以下简称10X）。但是基于2017年Christoph Ziegenhainet al[1]对6种单细胞转录组技术及2019Broad研究所的团队对7种单细胞RNA测序方法进行了比较[2]，某些特殊或者少量细胞样本的单细胞转录组研究中，Smart-seq2技术还是一项研究利器。Smart-seq2与10X技术的区别与应用的科研场景有哪些呢？北京大学张泽民团队在2019年发表的预印文章“..

2020-07-06 14:57:37 7523

原创易基因：朱健康团队WGBS揭示主动DNA去甲基化缺失植物的DNA甲基化跨代增加｜PNAS

本研究对理解基因组DNA甲基化的进化以及生存环境如何通过表观遗传影响后代具有重要意义

2024-09-12 10:30:42 604

原创易基因：Adv Sci：ACE等揭示产前不良环境暴露通过DNA羟甲基化变化介导子代自闭症｜国人佳作

最后线粒体α-酮戊二酸（α-KG）合成的关键酶IDH2和TET酶的辅因子α-KG，在1-NP组的胎儿前脑中减少（图7M–O）。分析α-KG对1-NP引起的中间神经元迁移相关基因表达减少的影响（图8G–I），结果表明，妊娠期间补充α-KG缓解了1-NP在胎儿前脑中引起的Sema3F、Nrg1和Erbb4减少（图8G–I）。此外，研究还表明补充α-酮戊二酸（α-KG，TET酶的辅因子），可以逆转1-NP诱导的中间神经元迁移相关基因特定位点的低羟甲基化，缓解中间神经元迁移延迟并改善由1-NP引起的自闭症。

2024-09-11 11:25:52 1100

原创项目文章｜PNAS：中国农大田见晖教授团队揭示DNA甲基化保护早期胚胎线粒体基因组稳定性

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。在早期哺乳动物胚胎中，线粒体氧化代谢增强是着床后生存和发育的重要特征；着床前期的线粒体重塑是正常胚胎发生的关键事件。在这些变化中，氧化磷酸化（OXPHOS）增强对于支持着床后胚胎的高能量需求至关重要，但线粒体氧化代谢的增强，同时也导致线粒体内大量ROS的积累，由此产生的线粒体氧化应激会破坏早期胚胎线粒体DNA（mtDNA）稳定性。

2024-09-05 10:30:56 348

原创易基因：血液Target-BS揭示靶向DNA甲基化标记水平与患者乳腺癌风险相关｜Nature子刊

p=0.048）中的高甲基化；易基因建立的靶基因甲基化高通量测序（Target Bisulfite sequencing，Target-BS）是针对已有目标基因panel组合，运用易基因自主研发的甲基化特异性多重PCR引物设计软件，对亚硫酸盐转化后的目标基因多重扩增，建库后进行超高深度（1000X以上）甲基化精准检测。位点cg47596828-EPCAM、cg47630224-MSH2、cg23652916-PALB2和cg89786999-FANCI在患者中显示出统计学上显著的甲基化水平增加。

2024-09-03 15:11:12 845

原创易基因：多组学测序分析揭示m5C甲基化上调E2F1表达以促进卵巢癌肿瘤进展｜Nature子刊

5-甲基胞嘧啶（m5C）是一种常见的RNA修饰，其在转录后水平调控基因表达，但m5C RNA修饰与生物分子凝聚以及转录因子介导的转录调控之间的交互作用，在卵巢癌中的了解还很有限。运用组蛋白特定修饰的特异性抗体或DNA结合蛋白或转录因子特异性抗体富集与其结合的DNA片段，并进行纯化和文库构建，然后进行高通量测序，通过将获得的数据与参考基因组精确比对，研究人员可获得全基因组范围内某种修饰类型的特定组蛋白或转录因子与基因组DNA序列之间的关系，也可对多个样品进行差异比较。每3天检测一次形成的肿瘤体积（h）。

2024-08-29 10:31:56 964

原创易基因：Exp Mol Med：ChIP-seq等揭示Foxo1-YAP-Notch1轴在疾病进展中的表观调控作用——重编程STING介导的先天免疫

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。非酒精性脂肪性肝炎（nonalcoholic steatohepatitis，NASH）是一种慢性肝脏疾病，其特征是肝脏中脂肪积累、炎症和纤维化。干扰素基因刺激因子（stimulator of IFN genes，STING）是一种细胞质DNA传感器，与NASH中的炎症激活有关。先天免疫激活对于NASH进展期间引发肝脏炎症至关重要，然而免疫调节分子如何识别脂肪生成、纤维化和炎症信号的机制尚不清楚。

2024-08-27 10:17:52 1055

原创易基因：泪腺RRBS+RNA-seq揭示Sjögren综合征相关干眼症的潜在基因｜项目文章

NOD小鼠泪腺中上调的Itgal、Icosl、Vav1和Irf4基因与T细胞介导的免疫反应密切相关，可能在SS相关干眼症的发病机制中发挥重要作用。本研究研究结果揭示了T细胞免疫相关基因的表观遗传调控在SS相关干眼症进展中的关键作用，并表明了DNA甲基化调控基因如Itgal、Vav1、Irf4和Icosl可能作为SS相关干眼症治疗的新靶点。(G) 与对照组4周龄小鼠相比，SS相关干眼症NOD小鼠Icosl（n=3）、Irf4（n=3）、Vav1（n=3）和Itgal（n=3）基因的MSP表征。

2024-08-22 14:01:00 561

原创易基因：群体表观遗传学：植物组学时代的DNA甲基化研究

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化在许多生物过程中发挥着重要作用。得益于数十年来对DNA甲基化突变体的研究，如今对DNA甲基化的建立和维持机制有了很好的理解，尤其在拟南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研究。最近的研究利用自然品系甲基化组进行的全基因组关联研究（GWASs）从群体水平上揭示了DNA甲基化变化的复杂而独特的遗传基础。亚硫酸盐处理后的测序是量化DNA甲基化的杰出方法，此外最近开发的无亚硫酸盐检测甲基化方法，以及同时检测遗传和

2024-08-20 10:13:24 273

原创易基因：RNA修饰N4-乙酰胞苷（ac4C）的调控机制、检测方法及其在癌症中的作用最新研究进展｜新方向

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。N4-乙酰胞苷（ac4C）是一种高度保守的化学修饰，广泛存在于真核和原核生物RNA中，如tRNA、rRNA和mRNA。这种修饰与多种人类疾病显著相关，尤其是癌症，其形成主要依赖于N-乙酰转移酶10（NAT10）（唯一已知ac4C的writer蛋白）的催化活性。本文讨论了ac4C的检测技术及其调控机制，并总结了ac4C与肿瘤发生、发展、预后和药物治疗的相关性。此外还对早期肿瘤诊断和预后预测的新生物标志物以及肿瘤治疗的新靶点进行了评论。由于ac4C是

2024-08-15 11:21:48 1100

原创易基因：儿童和成人实体瘤共有微小差异甲基化区域(mDMR)的全面分析 | 表观研究

研究在11种不同儿童癌症类型的31个复发性儿童肿瘤组织、13个邻近正常组织和20个血浆游离细胞(cell-free，cf)DNA样本上进行全基因组重亚硫酸盐测序(WGBS)，定义了多种癌症类型样本间差异甲基化的最小焦点区域，称之为微小差异甲基化区域(minimally differentially methylated regions，mDMRs)。全基因组重亚硫酸盐甲基化测序（WGBS）可以在全基因组范围内精确的检测所有单个胞嘧啶碱基（C碱基）的甲基化水平，是DNA甲基化研究的金标准。

2024-08-13 10:08:22 879

原创易基因：干旱胁迫下的作物DNA甲基化动态变化 | 植物抗逆

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。干旱（Drought）会对植物的生长、发育和生产力造成严重损害，是最具危害性的环境因素之一。植物已经进化出复杂的调控网络和干旱胁迫的抗性策略。作为一种保守的表观遗传调控，DNA甲基化变化可以改变植物对非生物胁迫响应中的基因表达和染色体互作。基因组学、表观基因组学和转录组学等组学技术的发展促进了非模式作物物种表观遗传变异研究的快速增长。本文总结了干旱胁迫下作物DNA甲基化作用的最新研究成果，包括甲基化和去甲基化酶、整体甲基化动态变化、DNA甲基化对

2024-08-08 10:13:59 892

原创易基因：哺乳动物胎盘DNA甲基化变化和胎儿出生体重的综合分析 | 科研速递

从外圈到内圈依次是：基因密度、CpG岛、HBW胎盘平均甲基化水平、LBW胎盘平均甲基化水平、高甲基化DMR（hyper-methylated DMRs）、低甲基化DMRs（hypo-methylated DMRs）、HBW胎盘的平均甲基化水平、LBW胎盘的平均甲基化水平。易基因提供全面的表观基因组学（DNA甲基化、DNA羟甲基化）和表观转录组学（m6A、m5C、m1A、m7G）、染色质结构与功能组学技术方案（ChIP-seq、ATAC-seq），详询易基因：0755-28317900.M：甲基化等位基因；

2024-08-06 10:19:57 843

原创易基因：MeRIP-seq+RNA-seq揭示家禽(鸡)脂肪沉积中的m6A RNA甲基化调控机制｜项目文章

将6只100日龄的雌性三黄鸡根据腹部脂肪比例被分为高脂组（n=3）和低脂组（n=3），并对其腹部脂肪组织进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析。差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示。

2024-08-01 13:58:46 788

原创易基因：MeRIP-seq+RNA-seq揭示家禽(鸡)脂肪沉积中的m6A RNA甲基化调控机制｜项目文章

将6只100日龄的雌性三黄鸡根据腹部脂肪比例被分为高脂组（n=3）和低脂组（n=3），并对其腹部脂肪组织进行MeRIP-seq和RNA-seq分析。m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析。差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示。

2024-08-01 13:45:37 698

原创易基因：m6A/m5C/m1A/m7G/ac4C/Ψ等8种RNA修饰的生物学功能和潜在机制 | 深度综述

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RNA修饰近来已成为热门话题，它们通过影响RNA生成、转运、功能和代谢等过程，是细胞生物学的关键调节因子。本文介绍了包括N6-甲基腺苷（m6A）、5-甲基胞嘧啶（m5C）、N1-甲基腺苷（m1A）、N7-甲基鸟苷（m7G）、N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）、假尿苷（Ψ）、尿苷化和腺苷-肌苷（A-to-I）RNA编辑在内的8种RNA修饰的生物学功能和作用机制，这些修饰由RNA修饰酶（“writers”，“erasers”和“readers”）进行添加、

2024-07-30 10:13:05 449

原创易基因：通过cfDNA甲基化和半甲基化分析结合机器学习检测多癌种生物标志物

的研究论文，研究通过cfMeDIP-seq结合机器学习方法分析了肝脏肿瘤和血浆游离DNA（cfDNA）中的差异半甲基化区域（DHMRs），揭示了大多数DHMRs与相同样本中的差异甲基化区域（DMRs）不重叠，表明DHMRs可以作为独立的生物标志物。结合DMRs+DHMRs的模型，比只使用DMRs或DHMRs训练的模型表现出更优越的性能，在验证队列中，区分对照组、肝癌和脑癌的AUROC值分别为0.978、0.990和0.983。e. 使用训练有DMRs+DHMRs的模型，每组样本的平均预测概率。

2024-07-26 09:51:23 335

原创易基因：RNA m6A甲基化修饰和特定基因m6A位点的检测方法｜干货分享

该方法片段化的RNA与m6A抗体孵育，然后RNA-抗体复合物通过254 nm UV光交联，通过蛋白酶消化得到的氨基酸残基抑制逆转录中的碱基配对，导致在m6A位点附近发生片段化或突变，最终以单碱基分辨率获得m6A位点信息（图1A）。易基因MeRIP-seq技术利用m6A特异性抗体富集发生m6A修饰的RNA片段（包括mRNA、lncRNA等rRNA去除所有RNA），结合高通量测序，可以对RNA上的m6A修饰进行定位与定量，总RNA起始量可降低至10μg，最低仅需1μg总RNA。

2024-07-24 10:05:59 1069

原创易基因：全基因组DNA甲基化测序数据工作流程分析和性能评估分析软件比较 | 生信专区

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。DNA甲基化与转录调控、基因组印记、干细胞分化、胚胎发育和炎症等过程有关。DNA甲基化异常可能揭示疾病状态，包括癌症和神经系统疾病。因此，人类基因组中5-甲基胞嘧啶（5mC）分布和位点是一个重要的研究方向。全基因组重亚硫酸盐测序(Whole-genome bisulfite sequencing, WGBS)是一种用于分析DNA甲基化的高通量方法，本文综述了WGBS的关键步骤，总结了可用且最新的分析工具，比较了比对算法，并分享了数据处理的示例代码

2024-07-17 10:04:08 879

原创易基因：表观多组学揭示SETDB1调控神经前体细胞的短散在核元件和染色质环构象｜Genome Biol/IF10.1

Setdb1基因敲除增加了CTCF对这些SINE元件的可及性，CTCF与这些位点结合介导染色质环的重分布。2024年7月3日，复旦大学脑科学研究院江燕课题组与基础医学院刘赟课题组博士后蒙伟达合作共同通讯，利用广泛的表观基因组分析，包括ATAC-seq、抗H3K9me3 ChIP-seq、WGBS、抗CTCF ChIP-seq、原位Hi-C以及RNA-seq分析，揭示了小鼠神经前体细胞（NPCs）中组蛋白甲基转移酶SETDB1调控SINEs活性和染色质环构象的表观遗传分子机制，及其在NPCs增殖中的作用。

2024-07-15 11:26:16 626

原创易基因：微量样本及单细胞DNA甲基化研究如何发高分SCI文章（特别适用珍稀样本）

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。单细胞及微量样本的DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术。传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。易基因建立了一系列微量及单细胞甲基化检测方法，可对于不同项目需求，个性化提供检测方案，在全基因组、简化基因组、靶基因等范围开展甲基化检测。

2024-07-10 11:05:26 914

原创 cfDNA甲基化疾病早筛研究思路分享

ctDNA甲基化是重要的表观学修饰之一，可以在不改变基因序列的情况下，改变遗传表现，从而调控基因表达。基因甲基化发生是癌症发生的重要机制，相当于调控基因表达的“开关”，其稳定性和一致性较好，因此ctDNA甲基化是癌症肿瘤标志物筛查的理想手段。常规RRBS富集约70-350bp范围酶切片段，如对于CG含量高的片段将被切割的更碎而无法检测，保留下来的片段反而是CG含量低，无甲基化信息的基因片段。本周四（7月11日）晚19：00，易基因与您分享cfDNA甲基化疾病早筛研究思路。

2024-07-08 14:32:44 242

原创易基因：表观基因组cfDNA分析检测晚期EGFR突变肺腺癌患者的小细胞转化 | 肿瘤监测研究

箱线图显示了基于H3K27ac cfChIP-seq分析（A）、H3K4me3 cfChIP-seq分析（B）、cfDNA甲基化分析（C）或cfDNA染色质可及性分析（D）的EGFRm-LUAD和EGFRm-tSCLC患者血浆样本的cfDNA SCLC风险评分。”的研究论文，研究通过表观基因组cfDNA分析DNA片段的表观遗传学特征（如DNA甲基化、组蛋白修饰等），揭示了可以通过cfDNA表观基因组分析无创地检测EGFR突变型LUAD患者中的小细胞转化，从而识别和监测癌症的存在和进展。

2024-07-05 10:38:27 810

原创易基因：番茄果实采后处理成熟诱导的DNA甲基化和转录组综合分析 | 作物研究

研究人员将经过20°C、12.5°C或5°C冷藏（随后20°C回温）下暗储后达到Turning阶段（T）成熟果实与新鲜收获果实（fresh-harvest fruit，FHT）进行了比较。因此，研究采后处理诱导的番茄果实DNA甲基化和转录组变化对果实成熟和品质的影响，以及这些影响与成熟速度和成熟指标（如乙烯、脱落酸和类胡萝卜素）的相关性，对于改善果实品质具有重要意义。（ii）12.5°C（12.5T），和（iii）5°C持续两周，然后在20°C下回温（5T）。对照组为新鲜收获的成熟果实（FHT）。

2024-07-02 10:24:16 385

原创易基因：围产期母体有毒物质暴露对子代血液、大脑和肝脏DNA甲基化的影响 | 研究速递

DMRs在Gnas和Grb10的印记调控区域(ICRs)中富集，再次观察到血液和目标组织之间DMRs特征的复制，主要是铅暴露的雄性动物的血液和肝脏中Grb10 ICR的高甲基化。2024年6月4日，美国密歇根大学Rachel K Morgan和Kai Wang合作分析了围产期发育期间，与人类相关的铅(Pb)和邻苯二甲酸盐(DEHP)暴露相关的大脑皮层、血液和肝脏中组织和性别特异性DNA甲基化(DNAm)变化。图7：在Pb和DEHP暴露组织的Gnas和Grb10ICR中检测到的DMR。

2024-06-27 10:15:06 844

原创易基因：微量DNA甲基化分析揭示MeCP2在卵子发生和卵巢衰老中的表观遗传调控｜项目文章

生长中的卵母细胞中的MeCP2过表达会导致转录失调、DNA高甲基化和基因组不稳定，最终导致卵泡生长停滞和凋亡。本研究通过微量甲基化测序和对应的转录组测序分析等揭示了MeCP2在卵巢中的功能和蛋白质降解机制，表明CRL4DCAF13 E3连接酶靶向MeCP2降解，从而防止DNA高甲基化并保持正常转录的新机制，并预示DCAF13-MeCP2轴异常参与卵巢衰老。在衰老的卵母细胞中，DDB1和DCAF13水平的降低稳定了MeCP2，导致CpG岛中的DNA高甲基化、转录失调和卵泡生长停滞。

2024-06-25 10:34:58 1017

原创重磅！2024年最新影响因子正式发布，附Excel下载

激动人心的时刻终于来了，2024年影响因子已全面发布！废话不多说，大家一起来看看最新的发布的结果吧！NEJM、The Lancet、JAMA、BMJ，这四本综合性医学杂志，是我们统称的。大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。毫无疑问，最高分必然是它，今年公布最新影响因子为503.1。，也是公认的历史最为悠久、顶级的综合性临床期刊。但几年看下来，四大刊已经有不小的变化……2024年度影响因子排名。”微信公众号后台回复：“

2024-06-21 10:15:47 456

原创易基因：MeRIP-seq等揭示RNA m6A去甲基化酶调控植物雄性不育的分子机制 | 科研速递

m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析。(l) 通过LC-MS/MS在14天龄的WT、Osalkbh9-1和Osalkbh9-2茎中纯化的mRNA中确定的m6A相对于腺苷的百分比（m6A/A比率）。差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示。

2024-06-20 10:41:40 286

原创易基因：NSUN2/YBX1介导m5C甲基化增强HGH1 mRNA稳定性以促进肿瘤进展 | 科研速递

研究结果表明，作为主要的m5C甲基化酶，NSUN2在BC中异常高表达，并提高了RNA m5C的整体水平。甲基化和转录数据联合分析结果表明，在BC组织中，有18个位点呈现高甲基化和高表达，25个位点高甲基化和低表达，16个位点低甲基化和高表达，以及38个位点低甲基化和低表达（图3E）。总之，本研究初步阐明了从转录后修饰到蛋白质翻译过程中NSUN2-YBX1-m5C-HGH1轴的调控作用，揭示了异常RNA m5C修饰在BC中的关键角色，并表明HGH1可能是一个新的表观遗传生物标志物和潜在的治疗靶点。

2024-06-18 11:03:22 886

原创易基因：RNA m6A甲基转移酶METTL14在儿童肿瘤进展中的作用研究 | 科研速递

总体而言，本研究为METTL14在NB细胞中的致癌效应提供了宝贵见解，突出了其通过m6A-YTHDF1依赖机制抑制YWHAH表达的作用。m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因的功能分析。差异m6A peak鉴定、非时序数据的分析策略、时序数据的分析策略、差异m6A修饰基因的功能分析、差异m6A修饰基因的PPI分析、候选基因的m6A修饰可视化展示。

2024-06-14 10:47:38 864

空空如也

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