Alt-R HDR设计工具及模板
借助智能易用的设计工具,提高CRISPR-Cas9介导的同源重组修复(HDR)的效率
利用 Alt-R CRISPR-Cas9 系统阳性对照crRNA组成的RNP在体外对柱纯化 Hs HPRT 扩增产物进行编辑。
体外基因编辑的体系为 10 μL,Sample1 为对照组,只含 Hs HPRT 基因编辑模板不含RNP;Sample 2 包含模板和 RNP。随后利用片段分析仪进行编辑效率分析。
如图所示,IDT 在线工具提供针对人、大鼠、小鼠、斑马鱼、线虫等多种模式生物的预设计 crRNA 序列库。用户只需选择物种和输入基因名即可获取预设计位点。
IDT crRNA 在线设计工具
如果预设计库中没有针对靶目标的「螺纹钉」,你可以输入 Fasta 序列进行定制设计并利用在线「crRNA 检查器」(CRISPR-Cas9 crRNA Checker)排查潜在的脱靶位点。IDT 在线工具凝结了很多科学家实践多年的心血,在设计层面充分把控了脱靶风险。