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RSS订阅原创 Hortic Plant J（IF=6.2）|DAP-seq助力解析CsTCP2调控柑橘叶片大小的分子机制
本研究阐明了柑橘中TCP转录因子调控叶片大小的分子机制，不仅丰富了木本植物叶片发育的理论体系，也为柑橘株型改良、光合效率提升和优质育种提供了关键基因靶点与重要理论支撑。
2026-06-09 15:53:46
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原创 Current Biology（IF=7.5）|DAP-seq助力解析TI3调控柑橘刺身份决定的分子机制
该研究系统揭示了柑橘刺与分枝的命运抉择机制，填补了植物分生组织命运决定的理论空白，为培育无刺柑橘品种提供了关键靶点与理论支撑，具有重要科学价值与应用前景。
2026-06-09 15:50:00
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原创 THE EMBO JOURNAL（IF=8.3）▏DAP-seq助力揭示SlZHD8调控番茄果实糖积累的分子机制
本研究系统阐明了盐胁迫下根系信号调控果实增甜的分子机制，为逆境促品质这一重要农业现象提供了核心理论支撑，并为番茄品质与抗逆协同改良提供了关键基因资源与育种靶点。
2026-06-09 15:06:57
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原创 Hortic Res（IF=8.5）▏DAP-seq助力解析SlbHLH70调控番茄耐旱性的分子机制
本研究系统解析了SlbHLH70调控番茄响应干旱胁迫的分子通路与作用机制，不仅深化了对植物抗旱机制的认识，更为番茄抗逆遗传改良提供了重要候选基因与理论支撑。
2026-06-09 14:59:40
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原创 生物大分子互作技术——Pull-down详解
分子互作是生命活动的基础，不同生物分子之间的识别、结合与调控，贯穿于基因表达、信号传导、细胞命运决定等几乎所有生命过程。生物分子间的相互作用（蛋白-DNA、蛋白-RNA、蛋白-蛋白）是生命科学研究的核心内容，也是揭示基因调控、蛋白功能及疾病机制的关键。Pull-down实验（又称拉下实验）既能用于筛选未知互作分子，也可用于验证已知分子间相互作用。根据研究对象的不同，主要分为蛋白Pull-down、DNA Pull-down和RNA Pull-down三大类。
2026-05-25 17:30:30
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原创 Plant Cell Environment（IF=6.3）▏DAP-seq技术助力揭示三叶草TaUPL21调控根系发育的分子机制
研究团队从高加索三叶草中鉴定出32个TaUPL基因，其中TaUPL21在根茎芽中特异性高表达，成为调控根系生长的核心候选基因。功能验证显示，过表达TaUPL21可显著提升根长、根体积、根尖数与根表面积，直接证实其正向驱动根系发育的关键作用。通过DAP-seq全基因组鉴定TaUPL21结合位点，两个生物学重复分别鉴定出1607和1066个结合峰，其中11.2%的峰位精准定位在基因启动子区域；GO与KEGG富集显示其靶基因参与次生代谢、基因组稳定、表观调控、胁迫响应与发育调控等多种过程。
2026-05-25 15:32:20
320
原创 Advanced Science（IF=14.1）▏DAP-seq助力揭示CsYABBY3调控大麻腺毛分化与大麻素合成的分子机制
研究团队利用多品种大麻以及多组织部位转录组，筛选并鉴定出大麻腺毛特异性高表达的FIL/YAB3家族转录因子CsYABBY3。功能验证表明，该因子不仅能促进腺毛的分化，还能显著提升CBD和CBG等主要大麻素的积累。研究通过DAP-seq全基因组结合位点分析，共鉴定出3154个CsYABBY3结合峰，其中约12.4%位于基因转录起始位点上游2kb的启动子区域，并鉴定到显著富集的核心结合基序TAATTAA。
2026-05-12 14:33:05
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原创 组学数据必备！KEGG富集分析超详细解读，零基础也能看懂
KEGG富集分析，就是把我们筛选出的差异基因/差异代谢物，映射到KEGG数据库的各个生物学通路中，统计哪些通路被显著富集，从而判断这些差异分子主要参与哪些生命活动、调控哪些生物学过程。
2026-05-12 14:26:39
583
原创 New Phytol（IF=8.1）▏DAP-seq技术助力揭示水稻免疫调控分子机制
该研究利用RNA-seq比较onac122、onac131突变体、过表达株系与野生型的转录组差异，GO与KEGG富集分析表明，相关差异表达基因主要富集在植物-病原菌互作、MAPK 信号通路等免疫相关通路。
2026-05-12 13:29:48
324
原创 连发Cell/Science/Molecular Plant，DAP-seq如何成为植物功能基因研究关键技术？
在植物科学研究中，解析转录因子与DNA的特异性互作，是构建基因表达调控网络、揭示生命活动分子机制的关键环节。传统ChIP-seq技术因依赖目的蛋白特异性抗体，成为非模式植物研究的重要瓶颈。DAP-seq技术无需特异性抗体和转基因材料，可全基因组鉴定转录因子结合位点，为模式/非模式生物研究提供高效方案。
2026-04-30 10:41:59
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原创 JIPB（IF=9..3）▏DAP-seq技术助力揭示低氮胁迫下毛白杨木材形成的分子调控机制
过表达株系与野生型（WT）杨树的差异显著表达基因（SDEGs）数量，以及低氮（LN）与正常氮处理的野生型杨树间的差异显著表达基因数量。转基因植株与野生型植株茎的木质部宽度（E）、木质部/茎横截面积比（F）、导管频率（G）、导管管腔面积（H）及双纤维细胞壁厚度（I）。转基因及野生型杨树茎的木质部宽度（E）、木质部/茎横截面积比（F）、导管频率（G）、导管管腔面积（H）及双纤维细胞壁厚度（I）。C）与正常氮供应的野生型杨树相比，两组对比中共同参与木质素生物合成且呈同步上调或下调的差异显著表达基因的表达水平。
2026-04-17 15:30:01
339
原创 韦恩图在线绘图工具
韦恩（Venn）图是常见统计图之一，也是科研文章中最常见展示形式之一。主要用于展示各样本（或分组）之间共有（或特有）元素的数量（或比例）。用来描绘多个数据集之间的关系。
2026-04-17 15:17:46
733
原创 Science Advances（IF=12.5）| DAP-seq助力揭示血吸虫雌虫性成熟的分子调控机制
本研究解析了BATT调控雌性生殖成熟的分子机制，发现转录因子znf362的长异构体znf362.1是BATT诱导雌性卵巢和卵黄腺成熟的下游关键调控因子，该因子在BATT处理后，于卵巢卵母细胞和卵黄腺S1细胞中特异性上调，且仅调控生殖干细胞的分化过程，不影响其增殖。
2026-04-16 11:54:46
409
原创 Horticulture Research（IF = 8.5）▏DAP-seq技术助力揭示MeJA缓解桃果实冷害的分子机制
作为典型的跃变型果实，因风味佳、营养丰富占据重要市场地位，但采后冷藏易引发冷害（CI），表现为表面凹陷、内部褐变（IB）、成熟受阻等症状，其中内部褐变主要由酚类物质的酶促氧化导致，严重降低果实商品性。茉莉酸甲酯（MeJA）作为植物信号分子，已被证实可增强多种果实的耐冷性，其作用与乙烯合成、抗氧化能力提升等生理过程相关，但MeJA介导桃果实耐冷性的分子机制，尤其是关键转录因子MYC2的调控网络及JAZ蛋白的调控作用，尚未明确。图4 PpMYC2.1介导的桃果实乙烯合成相关关键转录因子（TFs）的直接调控。
2026-04-03 16:58:27
385
原创 Hortic. Plant J（IF=6.2）| DAP-seq和RNA-seq联合助力揭示SmBBX22调控茄子花青素合成的分子机制
该研究通过DAP-seq与RNA-seq技术联合分析，成功鉴定出SmBBX22的下游靶基因，明确其通过调控苯丙烷类和黄酮类生物合成通路正向调控茄子花青素合成的分子机制，不仅填补了茄子SmBBX基因家族调控机制的研究空白，更为作物品质改良提供了关键分子靶点。基因在茄子不同发育阶段的功能作用，研究团队通过RNA-seq分析，鉴定出不表达、组成型表达和组织特异性表达三种模式，其中3个基因全程不表达，8个基因在各组织/器官中组成型高表达（如。以上结果共同证实，SmBBX22是茄子花青素生物合成的关键调控因子。
2026-04-03 16:37:51
336
原创 小鼠肝脏翻译组解析利器-Polysome Profiling多组学联用研究范式
Polysome Profiling（多聚核糖体图谱分析） 以蔗糖密度梯度离心为核心，实现核糖体亚基、单核糖体、多聚核糖体的高效组分分离，是解析小鼠肝脏实时翻译活性、翻译效率、翻译调控网络的金标准技术。结合qPCR、Polysome-seq、Western Blot（WB）多技术联用，可从单基因验证到组学全景、从RNA到蛋白层面，全面解码肝脏生理病理过程中的翻译调控机制，为代谢疾病、肝损伤、衰老等研究提供精准分子依据。
2026-03-18 16:15:42
430
原创 DAP-seq实用研究思路助力植物转录调控研究
在植物科学领域，解析转录因子与DNA的互作机制是构建基因表达调控网络的核心，更是揭示植物生长发育、逆境适应等生命过程分子机制的关键。传统的ChIP-seq技术依赖高质量特异性抗体，这一局限性使非模式植物的研究面临巨大挑战。DAP-seq（DNA Affinity Purification Sequencing，DNA亲和纯化测序）技术的出现，为研究模式和非模式植物的转录调控研究提供了高效、精准的解决方案。本文将系统解析三种基于DAP-seq的转录调控研究思路，以期为相关领域的科研工作者提供有益的思路与启发。
2026-03-18 15:53:52
408
原创 Plant Physiology（IF=6.9）▏DAP-seq技术助力揭示独脚金内酯调控苹果腋芽生长的分子机制
2025年10月14日，中国农业大学李威教授团队在Plant Physiology（IF=6.9）上发表了一篇题为“Strigolactones inhibit axillary bud outgrowth through transcription factor MdSPL6-mediated regulation of ABA levels in apple”的研究论文。
2026-03-18 15:29:42
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原创 基因组信号可视化实战：IGV 的另一种选择——pyGenomeTracks
在实际分析中，不需要手工编写复杂的配置文件，而是通过以下命令自动生成：make_tracks_file --trackFiles S1.bw S2.bw Input.bw peak_location.bed sample.gff3 --out tracks.ini。这种“看图说话”的方式，不仅能帮助我们快速评估实验质量，也为后续的峰值筛选、功能注释和生物学解读提供了直观可靠的依据。在一些生信分析项目中，将测序信号直观地展示在基因组上，是用户最容易理解、也最有说服力的结果形式之一。
2026-02-10 16:59:44
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原创 Polysome profiling下游实验 | 附文献分享
研究通过创新的 Disome-seq 技术（测序双核糖体保护的 mRNA 片段），系统揭示了酵母细胞中广泛存在的核糖体碰撞现象及其在蛋白质折叠调控中的关键作用。该研究证明核糖体碰撞是细胞调控蛋白质稳态的普遍策略，通过序列特异的翻译暂停和伴侣蛋白协同，确保新生肽链的正确折叠，为理解蛋白质折叠疾病（如神经退行性疾病）提供了新视角。在polysome profiling的基础上，提取多聚核糖体各组分样本中的RNA，进行RNA-seq测序，深入分析特定mRNA的翻译状态和多聚核糖体分布特征。
2026-02-06 16:25:31
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原创 m6A文章解读-YTHDF1调控结直肠癌免疫抑制与免疫治疗耐药
结直肠癌（CRC）是全球高发恶性肿瘤，微卫星稳定型（MSS）CRC 占比超85%，对PD-1/PD-L1免疫检查点抑制剂原发耐药，核心原因是肿瘤微环境（TME）呈“冷肿瘤”特征——CD8⁺效应T细胞浸润不足，髓系来源抑制细胞（MDSCs）、调节性T细胞（Treg）等免疫抑制细胞大量富集，形成免疫抑制屏障。② 机制上，YTHDF1敲除后肿瘤内CD8⁺T细胞、IFN-γ⁺CD8⁺T、GZMB⁺CD8⁺T细胞浸润显著增加，MDSCs、Treg细胞显著减少；
2026-01-27 16:18:54
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原创 J Integr Plant Biol（IF: 9.3） ▏DAP-seq技术助力揭示光信号通过SlDML2介导的DNA去甲基化影响番茄果实整体成熟和代谢的调控机制
2025年10月23日，四川大学张阳教授团队在Journal of Integrative Plant Biology（IF: 9.3）在线发表了题为Light regulates tomato fruit metabolome via SlDML2‐mediated global DNA demethylation的研究论文，该研究借助DAP-seq技术阐明了番茄中“光信号—SlHY5—SlDML2—DNA甲基化—果实代谢”的调控链条，揭示了光信号通过调控DNA甲基化进而影响植物整体代谢网络的全新机制。
2026-01-21 16:41:01
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原创 Ribo-seq+翻译组学全流程套餐｜一站式解锁翻译调控“密码本”
该研究揭示了细胞质lncRNA在人类神经元分化中的双重角色——既作为调控RNA参与基因表达调控，又部分具备翻译功能产生功能肽，拓展了对lncRNA生物学功能的认知，同时为理解神经元分化的分子机制提供了新的视角，也为相关神经发育疾病的研究提供了潜在的分子靶点。1. 细胞质lncRNA在神经元分化中的差异表达调控：通过转录组分析发现，在人类神经元分化过程中，大量细胞质lncRNA呈现显著的差异表达特征，部分lncRNA在分化关键节点上调或下调，提示其可能参与神经元分化的时序调控。
2026-01-21 15:49:18
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原创 Science | DAP-seq助力揭示CsARF3调控黄瓜雌花形成分子机制
2025年12月11日，中国农业大学张小兰团队在国际顶刊Science上发表了一篇题为“ARF3-mediated auxin signaling is essential for sex determination in cucumber”的研究论文。
2025-12-26 16:19:36
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原创 【Mol Plant综述精读】植物中的染色质重塑：复合物组成、机制多样性及生物学功能
染色质重塑复合物是真核生物染色质结构的关键调控因子，通过ATP水解提供能量，调控核小体的组装、滑动、驱逐及组蛋白变体替换，进而影响基因转录、DNA修复及基因组稳定性。与酵母和动物相比，植物作为固着生物，需持续应对复杂多变的环境胁迫，其染色质重塑复合物即保留保守特征，又进化出独特的物种特异性，成为植物实现环境适应性反应的重要分子基础。近年来，借助生物化学、表观基因组学及蛋白质组学等前沿技术，植物染色质重塑机制的研究取得了一系列突破性进展。
2025-12-22 11:07:07
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原创 Chem Eng J （IF=13.2) | DAP-seq技术助力揭示Srcc1蛋白调控裂殖壶菌脂肪酸高效合成新机制
2025年11月11日，天津大学王方忠教授团队在Chemical Engineering Journal（IF: 13.2）在线发表了题为Accelerated fatty acid biosynthesis by an RCC1-domain protein enables record-high productivity in Schizochytrium的研究论文，该研究借助DAP-seq技术阐明了RCC1结构域蛋白Srcc1在裂殖壶菌中调控脂肪酸生物合成的机制及其在高密度发酵中的应用，将微生物油脂生
2025-12-17 13:51:06
730
原创 【收藏】蛋白 Pull Down：蛋白互作研究利器
体外研究蛋白质相互作用的经典方法，无需特异性抗体，灵活选择真核/原核蛋白表达体系，自动化设备提升通量并保持稳定性
2025-12-10 11:05:58
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原创 Polysome Profiling—解析翻译调控机制的金标准
这个过程主要受到四个水平的精密调控：转录调控、转录后调控、翻译调控和翻译后调控。翻译调控的幅度和强度。一条正在翻译的mRNA可同时结合多个核糖体，结合核糖体组分的RNA与胞质总RNA的比例可以直接反映翻译水平。(circRNA)等非编码RNA也可能存在翻译活性，产生功能性微蛋白，这进一步凸显了翻译组学研究的重要性。体翻译的mRNA,揭示基因表达在翻译层面的动态变化，包括翻译起始、延伸速率及潜在的非经典翻译事件。集40S、60S、80S和多聚核糖体，用于RNA或蛋白质分析，也可以通过酶。
2025-12-03 13:36:51
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原创 Ribo-seq—检测正在翻译的RNA信息 连接转录组学与蛋白质组学的桥梁
对核糖体结合的RNA片段进行测序，能够精确记录核糖体在翻译过程中的位置。通过体外蛋白表达技术，表达出带有标签的RNA结合蛋白（RBP），然后与RNA在体外进行孵育和结合，再分离出与目的RBP结合的RNA，结合高通量测序，可以鉴定出蛋白质结合的mRNA、lncRNA等与细胞命运紧密相关的重要RNA。通过RNA免疫沉淀技术富集与目标蛋白结合的RNA，再进行高通量测序，在全转录组范围内分析体内与特定蛋白相互作用的RNA分子，揭示RNA结合蛋白（RBP）与RNA互作，助力探索基因表达的转录后调控机制。
2025-12-03 13:31:18
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原创 Science | 利用大规模并行核糖体分析发现泛病毒ORF
2025年6月12日，美国麻省理工和博德研究所Pardis C.Sabeti团队在Science上发表了一篇题为“Pan-viral ORFs discovery using massively parallel ribosome profiling”的论文，结合寡核苷酸合成文库和Ribo-seq核糖体印迹分析，开展泛病毒ORF挖掘，本研究旨在建立一种高效、无偏的泛病毒ORFs发现方法，填补病毒翻译组学空白。
2025-12-03 11:58:50
927
原创 Molecular Plant（IF: 24.1） ▏DAP-seq技术助力揭示小麦氮高效利用与产量提升的分子机制
2025年9月27日，中国农业大学孙其信院士/邢界文教授团队在Molecular Plant（IF: 24.1）在线发表了题为An incoherent feed-forward loop coordinates nitrate uptake and tillering in wheat的研究论文，该研究揭示了小麦中TaNLP3通过非一致性前馈环（incoherent feed-forward loop）协同调控硝酸盐吸收与分蘖的分子机制，还鉴定出可直接用于育种的优异单倍型。
2025-11-26 14:38:39
654
原创 Cell Reports（IF: 6.9） ▏DAP-seq助力揭示SlWRKY14调控番茄果色和品质的新机制
2025年10月1日，浙江大学农业与生物技术学院汪俏梅教授课题组在Cell Reports（IF: 6.9）上在线发表了题为SlWRKY14 integrates carotenoid and flavonoid biosynthetic pathways to regulate coloration and quality of tomato fruits的研究论文。
2025-11-19 13:23:50
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原创 DeepWiki—开源的Github项目解构工具
DeepWiki是由人工智能初创公司Cognition推出AI代码分析工具，依托于该公司旗下的AI产品Devin运行，本质上是一个提供结构化知识管理的系统（https://deepwiki.com/deepskies/DeepWiki），通过对开源项目进行总结、提炼与结构化整理的方式帮助人们更轻松的理解Github项目。
2025-11-10 17:39:47
680
原创 Plant Biotechnol J（IF: 10.5）▏DAP-seq和RNA-seq联合助力揭示大豆异黄酮生物合成调控新机制
2025年10月25日，南京农业大学国家大豆改良中心喻德跃教授团队在Plant Biotechnology Journal（IF: 10.5）上在线发表了题为GmMYB4 Positively Regulates Isoflavone Biosynthesis via the GmMAPK6-GmMYB4-MBW Module in Soybean的研究论文。
2025-11-10 17:16:05
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原创 恭喜客户发表Nature子刊！糖基化修饰鉴定助力揭示禾谷镰孢菌致病新机制
2025年9月12日，中国农业大学植物保护学院朱旺升研究团队在国际权威期刊Nature Plants在线发表题为“An apoplastic fungal effector disrupts N-glycosylation of ZmLecRK1, inducing its degradation to suppress disease resistance in maize”的研究论文。蓝景科信为该研究提供了糖基化修饰鉴定检测技术支持。
2025-11-04 11:25:31
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原创 Ind Crop Prod（IF=6.2）| DAP-seq助力揭示PagHSF4调控杨树生长发育与耐盐性的分子机制
2025年7月29日，山西农业大学王升级团队在Industrial Crops & Products期刊发表了一篇题为“PagHSF4 mediates the biosynthesis of jasmonic acid and plant hormone signal transduction to regulate the growth and development as well as salt stress tolerance of poplar”研究论文。
2025-10-29 10:34:15
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原创 Ind Crop Prod（IF=6.2）|DAP-seq助力揭示ERF194调控杨树叶片发育的机制
2025年7月31日，山西农业大学王升级团队在Industrial Crops&Products期刊发表了一篇题为“ERF194 regulates poplar leaf development via the starch and sucrose metabolism under natural environments”研究论文。本研究聚焦杨树ERF194转录因子，借助DAP-seq技术揭示了其通过调控淀粉-蔗糖代谢通路影响叶片发育的分子机制，为杨树遗传改良提供理论与实验依据。
2025-10-29 10:18:36
579
原创 New Phytologist（IF=8.1）▏DAP-seq助力揭示杨树次生维管系统发育遗传调控机制
2025年7月，北京林业大学张德强教授课题组在New Phytologist（IF=8.1）发表了题为“Phylostratigraphic analysis revealed that ancient ohnologue PtoWRKY53 innovated a vascular transcription regulatory network in Populus”的研究论文。该研究借助DAP-seq技术揭示了全基因组复制（WGD）衍生的古老PS1 ohnologs（尤其PtoWRKY53）通过新功能
2025-10-29 10:09:25
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原创 祝贺客户喜得新突破，杨树研究成果三连发！
在林业科学研究中，杨树作为重要的模式树种和经济树种，其生长发育、抗逆性及木材形成的分子机制一直是研究热点。而解析转录因子与靶基因的相互作用，是解锁这些机制的关键。近期，北京林业大学张德强团队、山西农业大学王升级团队的3项杨树研究成果（发表于New Phytologist、Industrial Crops & Products）均采用我司DAP-seq技术，为杨树基因调控研究提供了核心支撑，该技术无需特异性抗体、无需转基因材料，即可高通量检测转录因子在全基因组结合位点，为杨树基因调控研究提供了高效技术解决方
2025-10-29 09:46:47
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原创 Plant Communications（IF: 11.6） ▏DAP-seq技术助力揭示番茄果实类黄酮生物合成的新机制
2025年9月9日，浙江大学汪俏梅教授团队在Plant Communications （IF: 11.6）上在线发表了题为SlBES1-mediated brassinosteroid signaling suppresses flavonoid biosynthesis in tomato fruit的研究论文，该研究借助DAP-seq技术鉴定了SlBES1及其同源基因SlBZR1的全基因组靶基因，揭示其对番茄果实类黄酮合成的调控作用及机制，为番茄品质改良提供理论依据。蓝景科信为该研究提供了DAP-seq
2025-10-20 15:37:42
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