蛋白和DNA的互作
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蓝景科信
主要技术服务:DAP-seq,RAP-seq,ChIP-seq,CUT&Tag,DNA Pull Down,Ribo-seq,EMSA,重组蛋白表达,蛋白Pull Down等生物大分子相互作用。
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Frontiers in Microbiology:DAP-seq技术在猪苓C2H2转录因子PuCRZ1调控菌丝生长及渗透胁迫耐受性机制研究中的应用
DAP-seq高通量地检测转录因子在基因组上的结合位点,鉴定下游靶基因。蓝景科信拥有100+物种,1000+转录因子的DAP-seq实验经验。原创 2023-06-16 18:09:14 · 339 阅读 · 0 评论 -
DAP-seq技术鉴定葡萄MADS-box转录因子VvMADS28的靶基因,揭示葡萄胚珠发育的调控机制
DAP-seq高通量地鉴定转录因子在基因组上的结合位点,预测下游基因。该研究使用DNA亲和纯化测序(DAP-seq)技术鉴定了葡萄中一个MADS-box转录因子的结合基序及其靶基因,揭示了VvMADS28参与葡萄胚珠和种子发育的调控机制,为培育无籽葡萄新品种奠定了理论基础。原创 2023-05-15 17:03:07 · 946 阅读 · 0 评论 -
DAP-seq文章合集-蓝景科信
100+物种,1000+转录因子的实战经验,高通量鉴定转录因子的下游基因,已助力多篇文章发表知名期刊,例如:Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Journal of Integrative Plant Biology等。原创 2023-03-16 15:21:56 · 502 阅读 · 0 评论 -
DAP-seq文章-应用于鉴定玉米ZmR1的靶基因及对花青素合成调控的研究A newly characterized allele of ZmR1 increases anthocyanin
2022年7月5日,本公司客户在国际知名学术期刊Theoretical and Applied Genetics发表(IF=5.574)研究成果,本文主要研究内容是鉴定了玉米花青素合成相关等位基因ZmR1CQ01,并揭示了3个ZmR1等位基因的生物学功能和分子调控机制。其中DAP-seq鉴定了ZmR1靶基因,RNA-seq鉴定了差异表达基因(DEGs)。...原创 2022-08-02 16:24:26 · 723 阅读 · 0 评论 -
筛选鉴定与已经基因启动子相互作用的DNA结合蛋白-DNA Pull Down实验原理,技术流程
技术简介DNA Pull Down是一种新颖的DNA-蛋白互作技术,能够鉴定与特定DNA序列结合的蛋白(转录因子或者DNA结合蛋白)。DNA Pull Down使用生物素标记的DNA探针作为诱饵,与提取的内源细胞核蛋白进行孵育,捕获与DNA探针特异性结合的蛋白(比如转录因子),最终使用蛋白质谱的方法,鉴定出特异性结合的蛋白。蓝景科信服务优势探针长度设计范围广蛋白提取自新鲜组织和细胞,保持天然构象特异性强,假阳性率低适用于真核生物和原核生物实验周期短,高通量,高灵敏度DNA Pull D原创 2021-10-22 16:00:55 · 4279 阅读 · 0 评论 -
蓝景科信DAP-SEQ(DNA亲和纯化测序)技术服务常见问题(Input对照是什么?)
DAP-SEQ技术简介DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化,通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术,具有不受抗体和物种限制,且高通量的优势,自该技术问世以来,已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。那么关于DAP-SEQ都有哪些问题需要关注呢?1. DAP-seq原理、技术流程,能解决什么样的问题?原理:体外表达的蛋白和DNA进行亲和纯化,将与蛋白结合的DNA洗脱后进行高通量测序。技术流程:将编码转录因子的CDS序列构建到含有亲和标签的载体中,构建蛋白表达载体,进行体外蛋白表达,形成转录因子和亲和标原创 2021-03-19 15:46:12 · 2210 阅读 · 0 评论 -
研究蛋白和DNA的相互作用—EMSA(凝胶迁移或电泳迁移率实验),可用于DAP-seq后续验证
技术简介凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA,Electrophoretic Mobility Shift Assay)是研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。可用于DAP-seq后续验证实验。原创 2021-01-21 10:11:51 · 990 阅读 · 0 评论