用于3D成像显微镜的双螺旋PSF

最新推荐文章于 2024-10-03 08:09:54 发布
最新推荐文章于 2024-10-03 08:09:54 发布
阅读量390 收藏
点赞数 1
分类专栏： 光电 文章标签： 3d java servlet
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/Bonnie1985119/article/details/126967664
版权

摘要
 

双螺旋(DH) PSF工程在纵向上为三维成像提供了高分辨率，它可以通过在光瞳平面上增加一个带有漩涡的相位掩膜来产生[Ginni Grover等，Opt. Exp. 2012]。VirtualLab Fusion提供了一种快速方便的方法来计算高NA显微镜系统小离焦的DH PSFs。这个用例说明了DH-PSFs在离焦约130nm时有明显的变化。

建模任务
 

在VirtualLab Fusion中构建系统
 

系统构建块

 

元件解算器
 

利用光线追迹进行几何光学仿真
 

结果：几何光线追迹
 

利用场追迹进行物理光学仿真
 

不同离焦像面的双螺旋PSF
 

文件信息
 

Bonnie1985119
关注
专栏目录
easy-dhpsf:使用双螺旋PSF拟合3D单分子图像的GUI-开源
04-29
使用双螺旋点扩散函数（DH-PSF）宽视场显微镜时，这种附带MATLAB的MATLAB例程包可让科学用户测量单个分子的3D位置。 版本2还包含使用本地加权二次3D配准函数促进结合来自两个光谱通道的定位数据的代码特征-通过对明亮的固定荧光发射器（例如，磁珠）进行轴向扫描来校准双高斯估计量-通过进行DH定位来进行模板匹配和随后的双高斯拟合-使用模板匹配分析SM图像的Tiff堆栈，然后进行双高斯拟合以提取分子位置的估计值-通过从控制点对生成局部加权的二次映射函数来注册两个光谱通道
psf的matlab代码-SymmetricPSF:使用Matlab在两个光子显微镜中计算PSF的代码
05-24
psf的matlab代码对称PSF 使用Matlab在两个光子显微镜中计算PSF的代码此代码需要有关显微镜Kong径和焦点之间的介质长度的信息。 该代码仅适用于平行界面与成像光束的传播方向对齐的介质。 该代码基于Wolf的积分方法，因此更适合于具有高光圈的系统。
用于高NA显微镜成像的工程化PSF
Bonnie1985119的博客
09-21 301
显微成像技术在最近的几十年中得到迅速发展。 PSF（点扩散函数）通常不是像平面上的艾里斑。当对沿纵轴定向的偶极子源进行成像时，可以设计出一个甜甜圈形状。 我们在VirtualLab Fusion中证明，当偶极子源的方向发生变化时，会获得不同的非对称PSF（不是艾里斑）。 此外，可通过在显微镜系统的光瞳平面中插入一定的相位掩模来获得双螺旋PSF [Ginni Grover et al., Opt. Exp. 2012]。通过这种工程化的PSF，甚至可以观察到物体的微小散焦，即与传统的成像方法相比，可以大大提高
Realizing depth measurement and edge detection based on a single metasurface
qq_40843062的博客
03-07 1048
拓扑荷数越高的边缘检测结果的图像质量越差，与拓扑荷为1相比，是因为两个中心不对称点的相位差不在相等导致恶化了相消干涉。然后记录了相应的叠加孪生图像和距离物体焦点的距离Δz且通过深度提取算法，能够从图像中提取倒谱信息并获得结果。与此同时，基于螺旋相位的PSF在所有的轴向位置处有线性旋转率，可以时间旋转角度和深度之间的计算。该相位由一系列菲涅尔区组成。的数值分析和对DH-PSF局部方向的反演，可以反演出不同物点的距离。DH-PSF的旋转速率随着菲涅尔区数量的变化而变化，并且深度测量的扩展范围和N成反比。
psf的matlab代码-MicroscPSF-Icy:用于快速生成显微镜PSF的冰冷插件
05-24
psf的matlab代码这是该插件的Eclipse项目，用于实现快速的微观PSF（特别是Gibson-Lanni模型）生成工具。 技术细节可以在找到。 本身可以从bin文件夹下载。 参考文献： [1] J. Li，F。Xue和T. Blu，“荧光显微镜的...
psf的matlab代码-HR-FLFM:高分辨率傅里叶光场显微镜用于体积多色活细胞成像
05-24
高分辨率傅里叶光场显微镜用于体积多色活细胞成像 HRFLFM数据处理 该软件包包括数据预处理，图像背景减法，ACsN去噪算法和HR-FLFM 3D重建代码。 先决条件包括具有足够GPU内存的Nvidia GPU，Matlab 2020或更高版本，...
用于容积多色活细胞成像的高分辨率Fourier光场显微镜的PSF标定matlab代码.zip
03-31
1.版本：matlab2014/2019a/2021a 2.附赠案例数据可直接运行matlab程序。 3.代码特点：参数化编程、参数可方便更改、代码编程思路清晰、注释明细。 4.适用对象：计算机，电子信息工程、数学等专业的大学生课程...
一种基于能量分布的显微成像系统3D-PSF 选取方法
02-04
依据显微镜三维成像原理以及3D-PSF模型，分析了显微镜3D-PSF的能量分布和3D-PSF空间大小的关系，提出了一种通过复原效率与能量关系曲线拐点进行能量阈值确定，以实现3D-PSF空间大小选取的方法。模拟了生物光学显微镜...
psf的matlab代码-MicroscPSF-ImageJ:用于快速生成显微镜PSF的ImageJ插件
05-24
psf的matlab代码这是ImageJ插件的Eclipse项目，用于实现快速的微观PSF（特别是Gibson-Lanni模型）生成工具。 技术细节可以在找到。 本身可以从target文件夹下载。 参考文献： [1] J. Li，F。Xue和T. Blu，“荧光显微...
手把手教你如何获得光学成像系统的PSF（点扩散函数）——从beads成像到处理图像的经验分享
weixin_47658127的博客
02-23 6981
首先声明：仅发表个人理解，因为我的课题研究经历更多都是自己搜罗的资源，课题组其他人都没有做这个方向的，所以如果有不对的地方，欢迎评论区讨论。 1、样品的购买和制备 我们会使用beads，俗称荧光小球，它是一个点光源，具有一定的直径，一般是0.1um，0.2um，0.5um，1um等几个直径挡位，在不同的系统下，它能成像到的点扩散函数不一样，这是反应系统质量和参数的一个标准样本。 第一步是购买beads，一般会购买ThermoFisher的荧光小球，链接如下： 荧光微球，适用于多种生物学应用领域
点扩散函数 PSF（point spread function）
荒野孤舟的博客
11-26 8万+
*持续性补充拓展，以下部分来自wiki：https://en.wikipedia.org/wiki/Point_spread_function   点扩展函数(point spread function PSF)描述了成像系统对点源或点对象的响应。PSF更一般的术语是一个系统的脉冲响应（impulse response），PSF是聚焦光学系统的脉冲响应。PSF 在许多情况下可以被当作是图像中表...
点扩散函数point spread function (PSF)
热门推荐
不傻缺的专栏
01-13 12万+
概述概述 介绍 理论 历史和方法 显微镜中的PSF 天文学中的PSF 眼科的PSF References 点扩散函数（point spread function (PSF) 以下均使用PSF缩写）描述了一个成像系统对一个点光源（物体）的响应。PSF的一般术语就是系统响应，PSF是一个聚焦光学系统的冲击响应。在大多情况下，PSF可以认为像是一个能够表现未解析物体的图像中的一个扩展区块。函数上讲，PS
50. GLTF格式简介 (Web3D领域JPG)
Miller777_的博客
09-28 700
GLTF格式是新2015发布的三维模型格式，随着物联网、WebGL、5G的进一步发展，会有越来越多的互联网项目Web端引入3D元素，你可以把GLTF格式的三维模型理解为.jpg、.png格式的图片一样，现在的网站，图片基本是标配，对于以后的网站来说如果需要展示一个场景，使用3D来替换图片表达也是很正常的事情。.bin文件中的信息其实就是对应gltf文件中的buffers属性，buffers.bin中的模型数据，可以存储在.gltf文件中,也可以单独一个二进制.bin文件。
【2023工业3D异常检测文献】CPMF: 基于手工制作PCD描述符和深度学习IAD结合的AD方法
最新发布
qq_1532145264的博客
10-03 735
Complementary Pseudo Multimodal Feature for Point Cloud Anomaly Detection
【3D分割】Segment Anything in 3D with Radiance Fields
cjy_colorful0806的博客
09-27 1082
NeRF（Neural Radiance Fields）是用于表示3D场景的连续函数，通过多层感知机（MLP）将空间坐标 和视角方向 映射到相应位置的颜色 和体积密度。渲染图像时，NeRF通过光线投射技术生成每个像素点的颜色，公式如下：其中，权重 表示在射线路径 r(t)上的透明度和体积密度的综合效果，公式如下：其中 tn 和 t 分别为光线的近界和远界。
相互作用的检索增强 3D 分子生成扩散模型 - IRDiff 评测
wufeil7的博客
10-01 680
IRDiff 是一个全新的基于蛋白质-配体相互作用的检索增强 3D 分子扩散模型，可以生成目标感知的分子。IRDiff 利用一组设计好的参考配体分子来引导扩散模型生成满足目标特性的分子。 本文对 IRDiff 进行了评测，修正了GitHub上的代码错误，使用内置案例和自有案例对 IRDidd 进行分子生成测试，并检查生成结果。
3D-PSF选取新方法：基于能量分布的显微成像系统研究
为了验证这个方法的有效性，科研人员模拟了不同数值孔径（对应不同的放大倍数和分辨率）的生物光学显微镜的成像情况，生成相应的3D-PSF，并进行了细胞三维仿真图像的反卷积实验。实验结果表明，基于能量分布的3D-PSF...
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值