POJ 3080/ ZOJ 2784 : Blue Jeans - 串匹配，最长公共子串

大致题意：

给出一个DNA序列集合，求在所有序列中都出现的最长的碱基序列。（碱基序列e.g.：TAGACC）

若有多个，输出字典序最小的一个。

这里用朴素算法做的…

可用KMP

多多练手 。。

#include<iostream>
#include<cstdio>
#include<cstring>
using namespace std;
const int M = 15, S = 65;
int main(){
	int t;
	scanf("%d", &t);

	while(t--){
		int m;
		char p[M][S];

		scanf("%d", &m);
		for(int i = 0; i < m; i++)
			scanf("%s", p[i]);//存下所有串

		int len;
		char ans[S];//最长公共子串
		len = 0;

		for(int i = 0; i < strlen(p[0]); i++){//枚举子串判断是否目标子串
			for(int j = i + 2; j < strlen(p[0]); j++){
				char s[S];//提取该子串s
				strncpy(s, p[0] + i, j - i + 1);
				s[j - i + 1] = '\0';
				bool ok = true;
				for(int k = 1; ok && k < m; k++)
					if(strstr(p[k], s) == NULL)//strstr() - locate substring
						ok = false;
		
				if(ok && (j - i + 1 > len || j - i + 1 == len && strcmp(ans, s) > 0)){
					len = j - i + 1;
					strcpy(ans, s);
				}
			}
		}

		if(len < 3)
				puts("no significant commonalities");
			else
				printf("%s\n", ans);
	}
	return 0;
}