紫书习题3-7 DNA序列(DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368)
输入m个长度均为n的DNA序列,求一个 DNA序列,到所有序列的总Hamming距离尽量 小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数,例如,ACGT和GCGA的Hamming 距离为2(左数第1, 4个字符不同)。 输入整数m和n(4≤m≤50, 4≤n≤1000),以及 m个长度为n的DNA序列(只包含字母A,C,G, T),输出到m个序列的Hamming距离和最小的 DNA序列和对应的距离。如有多解,要求为字典序最小的解。不一定是原有的,所以构造最小
看了一些博客,了解到只需比较每列DNA序列相同位置上字母,出现次数最多的字母即为目标序列的字母,可以将DNA序列翻转对比。
例如,对于下面5个DNA序列:
TATGATAC
TAAGCTAC
AAAGATCC
TGAGATAC
TAAGATGT
TAAGATAC为最优解。
#include<bits/stdc++.h>
using namespace std;
struct A
{
char c;
int v;
};
int main()
{
int t;
cin>>t;
while(t--)
{
int m,n,d=0;
cin>>m>>n;
char ch[m][n]