题目描述:
一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例(定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。
给定一个很长的DNA序列,以及要求的最小子序列长度,研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度
输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串
import java.util.Scanner;
public class Main
{
public static void main(String[] args) {
Scanner scanner = new Scanner(System.in);
while (scanner.hasNext())
{
String str = scanner.nextLine();
int len = scanner.nextInt();
int index = 0;
int GC = 0;
for (int i = 0; i < str.length() - len; i++)
{
String sub = str.substring(i, i + len);
int G = 0;
int C = 0;
for (char c: sub.toCharArray())
{
if (c == 'G')
G++;
if (c == 'C')
C++;
}
int tmp = G + C;
if (tmp > GC)
{
GC = tmp;
index = i;
}
}
System.out.println(str.substring(index, index + len));
}
}
}